Следующую серию из 25 Late 298D (№№ 57-81) заказали 5 апреля 1939 г., но нехватка винтов "Ратье" сдерживала производство и 29 августа решили временно ставить двухлопастные деревянные винты фиксированного шага "Шавьер". Применение этого пропеллера вынудило уменьшить нормальный взлетный вес с 4600 кг до 4400 кг, а также заложить балласт в 55 кг, прикрепленный к вторым шпангоутам обоих поплавков.
В начале Второй мировой войны французский флот обладал четырьмя эскадрильями, вооруженными Late 298. Это были Т1 в Беррре, Т2 в Шербуре, НВ1 и НВ2 на борту плавбазы "Коммандан Тест". 15 сентября 1939 г. сформировали эскадрилью ТЗ, получившую машины этого же типа. К началу следующего месяца флот имел 53 гидроплана Late 298, еще 28 ожидали сдачи военным. 22 ноября 1939 г. заказали дополнительно 65 самолетов. 9 января 1940 г. в Бикароссе состоялась приемка 68-го серийного самолета (Late 298D). 15 января сформировали эскадрилью Т4, которая тоже должна была эксплуатировать "Латекоэры".
10 марта 1940 г. 81-ю серийную машину флот вернул фирме для переделки в разведчик Late 298Е. Длину кабины увеличили, а торпедную подвеску сняли, заменив ее подфюзеляжной гондолой для наблюдателя. Late 298Е должен был выполнять две функции: разведчика и патрульного самолета. В качестве последнего он нес стандартное вооружение из трех 7,5-мм пулеметов "Дарн" и двух бомб G2 весом по 75 кг. Дальность полета при этом составляла 1550 км.
На 10 мая 1940 г., когда немцы начали свое наступление, пять эскадрилий имели по 10 Late 298 каждая. Т1, Т2 и ТЗ базировались в Шербуре и Булони, а Т4, НВ1 и НВ2 находились на средиземноморском побережье Франции. Две последние эскадрильи располагались на берегу, после того как "Коммандан Тест" превратили в транспорт. Первоначально гидропланы, базировавшиеся в Булони, патрулировали побережье, прикрывая высадку союзных войск в Вальхерене. Однако, отсутствие в пределах досягаемости немецких кораблей и нехватка штурмовиков у французских ВВС вынудила бросить поплавковые самолеты против колонн немецких войск. 21 мая "Латекоэры" покинули Булонь, но продолжали бомбить с пикирования и обстреливать части противника, летая из Шербура. Примером боевых операций эскадрилий, вооруженных Late 298, можно считать вылет 23 мая. 18 гидропланов сбросили с пикирования 500-кг бомбы на мосты и перекрестки дорог между Булонью и рекой Соммой. Потеряли три самолета, сбитых истребителями Bf 109Е, и один, уничтоженный немецкими зенитками. Если бы не выдающаяся живучесть и прочность, а также прекрасная маневренность Late 298, потери несомненно были бы значительно больше.