Если Реденс всегда был больше «политиком», чем чекистом, то Заковский на эту роль не претендовал, оставаясь на твердой почве «практики» чекистской работы. В силу этого он и сосредоточился на текущей оперативной работе губЧК. В его характеристике за этот период отмечалось, что он «…будучи Нач. Особотде- ла Одесской губЧК, в 1920 г., непосредственно разработал и ликвидировал ряд крупных контрреволюционных организаций и шпионских групп, проводивших свою работу в Красной Армии в пользу польского и румынского генштабов»[18]. Так весной 1920 года, во время советско-польской войны, была ликвидирована местная сеть «Польской организации войсковой», группы «Национального Центра» и «Союза возрождения России», готовивших вооруженные выступления в Одессе и губернии.
С окончанием Гражданской войны на Украине на первое место ставился вопрос о борьбе с бандитизмом и повстанческим движением на Правобережье, существенно затруднявшими восстановление мирной жизни. Одним из центров этой борьбы стала Подольская губерния, имевшая выходы к польской и румынской границам, кишевшая бандами, периодически уходившими и возвращавшимися из-за кордона.
В марте 1921 года Заковского назначили председателем Подольской губернской ЧК (в дальнейшем — Подольского губернского отдела ГПУ) в Винницу, где ему предстояло работать три года. Руководство ВУЧК в лице ее председателя В.Н. Манцева и начальника Секретно-Оперативного управления и Особого отдела Е.Г. Евдокимова перебросило дополнительно в Подолию свои лучшие чекистские силы. Здесь Заковский встретил старых товарищей — членов Коллегии Подольской губЧК Э.Я. Грундман и Ф.Т. Фомина. Начальником секретно-оперативной части работал Владимир Николаевич Гарин, он станет на многие годы самым ближайшим товарищем и другом Заковского, его «тенью» в чекистском аппарате.
О многих эпизодах работы чекистов в Подольской губернии можно узнать из книги Ф.Т. Фомина «Записки старого чекиста», а мы ограничимся лишь кратким перечнем операций, в которых довелось участвовать члену коллегии и начальнику Административно-организационного отдела Подольской губЧК Э.Я… Грундман, изложенным в ее автобиографии: «…За время работы участвовала и руководила ликвидацией следующих банд: банда Нечая — сдалась благодаря агентурной работе среди банды и лично ездила на переговоры. Банда Шевчука — была уничтожена в бою. Атаман сдался. Банда Лихо — половина сдалась во время переговоров, другая половина во время боя разбита и убит сам атаман Лихо. Банда Артема — атаман был взят, когда я осталась заложником в банде, где, в общем, пробыла как заложница 7 суток. Остальная банда мне сдалась по прибытии в г. Винницу, в момент разоружения мною с помощью 4 сотрудников. Комсостав банды в количестве 15 человек оказывал сильное сопротивление, в результате 8 человек бандитов было убито. Остальные разоружены…»