На "Двенадцати Апостолов" предложили снять всю старую артиллерию и взамен установить четыре новых 254-мм орудия в двух башнях с 203-мм броней и несколько 152-мм орудий во вновь устроенном каземате. По подсчетам, общая стоимость перевооружения составит 1 275000 рублей, а перегрузка не превысит всего 15 т. С применением более легкой крупповской брони сам корабль представлялось более рациональным забронировать.
После долгих споров через год в МТК пришли к мнению, что ряд "додредноутов" потеряли свое боевое значение. Для "Двенадцати Апостолов" на это решение повлияло еще отсутствие брони в оконечностях и наличие продольной водонепроницаемой переборки, что заметно ухудшало остойчивость при повреждениях. Поэтому корабль вывели из состава действующего флота, одновременно отменив и замену котлов, рассчитывая на успешную работу старых, под давлением в 7 атм., в течение последующих трех лет.
Параллельно с проектом, составленным в МТК и МГШ, в штаб Севастопольского порта поступил проект перевооружения, составленный главным инженер- механиком корабля полковником Кузнецовым. Пробыв в этой должности более 14 лет, то есть отдав кораблю часть своей жизни, он помнил то время, когда броненосец проходил ходовые испытания. Зная корабль лучше, чем "теоретики" из Санкт- Петербурга, Кузнецов считал, что, сохранив ту же мощность машин, но уменьшив перегрузку, заменив артиллерию, котлы и часть старой сталежелезной брони на круп-
повскую, вдвое меньшей толщины, экономия в весе достигнет 680 тонн, а осадка уменьшается на 0,48 м. Флот получает довольно-таки боеспособный корабль со скоростью хода 17 узлов. "При таких условиях "Двенадцать Апостолов" получит надлежащие морские качества и может занять с успехом место в рядах судов нашего активного флота", – так писал Кузнецов в докладной записке.
Свой проект он передал прямому начальнику капитану над Севастопольским портом, откуда он 4 декабря 1907 г. и поступил в штаб Черноморского флота.
"Чернорабочий" от флотского офицерства, каким являлся полковник Кузнецов, будучи истинным патриотом не только флота, но и своего корабля, написал в сопровождавшем рапорт "обосновании" своего проекта простые, но пророческие слова, что "для возрождения флота у Родины нашей нет золота". И, хотя высшие чины Морского ведомства, отказав ему, считали так же, это не помешало им незадолго до этого заказать по явно устаревшему проекту рекордную серию из 24 эскадренных миноносцев класса "Доброволец", и продолжить работы по строительству в Либаве "бездонного" в финансовом отношении и, как оказалось, ненужного порта имени Александра III.