Обыскали всех "неблагонадежных", а Пейпину, кроме того, вспомнили еще и то, что он в 1906 г., будучи молодым матросом, проходя службу на учебном судне "Опыт" (бывшая императорская яхта "Ливадия"), состоял в организации "социалистов-революционеров". Обыск произвели напрасно – "авторства" матроса Пейпина не установили, и тюрьмы ему удалось избежать. Подозревали в революционной деятельности и матроса Данилу Володина, также призванного в 1906 г. В июле 1910 г. на корабль вернули сбежавшего ранее матроса 2 статьи Н.И. Вахсаева. Его после долгих поисков все же поймали в деревне, из которой и призывали. С одного из кораблей первой линии прибыл матрос Брыскин. До этого он, будучи унтер-офицером, на одном из построений или, как говорится в деле, "в присутствии офицеров" сорвал с себя нашивки и знаки различия. Брыскина разжаловали и послали на "Двенадцать Апостолов"
Самодержавие медленно и неуклонно разваливалось. На флоте, даже несмотря на интенсивные плавания и частые стрельбы, несопоставимые по своему уровню с довоенными годами, революционное брожение все же усиливалось. В феврале 1911 г. с "Иоанна Златоуста" – новейшего корабля флота на "Двенадцать Апостолов" прислали сразу 10 "неблагонадежных". Это были моряки машинной команды, которые стали "по своему политическому направлению весьма нежелательными на корабле". И революция, которая нагрянет после очередной авантюры царизма – первой мировой войны, готовилась и в те, как всем казалось, безмятежные годы.
Но для моряков с "Иоанна Златоуста" служба на "линкоре-блокшиве" оказалась недолгой, тогда же в феврале старый броненосец решили исключить из списков флота. В марте 1911 г. его передали в "порт", а через месяц, 4 апреля, последовал приказ за № 99 об исключении его, вместе с ровесниками пятью номерными миноносцами, из списков кораблей флота. На этом окончилась история "Двенадцати Апостолов" как корабля, числившегося в составе флота.
И тем не менее история распорядилась так, что корпус броненосца еще долго стоял в Севастопольской гавани. Минула первая мировая война, затем огненным вихрем пронеслась революция, а за ней и интервенция.
В начале 20- х годов, когда страна лежала в разрухе, корпуса боевых кораблей, оставшихся в Севастополе, начали постепенно разбирать.
Но корпус "Двенадцати Апостолов" и в этот раз уцелел. Судьба ему приподнесла своеобразный сюрприз. На некоторое время он стал съемочной площадкой для работы над бессмертным фильмом Сергея Эйзенштейна "Броненосец Потемкин". Устроители декораций постарались на славу – только при неоднократном просмотре этого фильма, да и то используя эффект стоп-кадра, можно рассмотреть знакомые "очертания" бортов нашего броненосца. К осени 1925 г. фильм отсняли. И лишь спустя несколько лет приступили к разборке корпуса. Она длилась долго. Существуют данные, что окончили ее только в середине 30-х годов.