Прошло 2 недели, прежде чем японцы смогли отправить новые подкрепления. Однако в любом случае, они высадили около 45000 солдат на западном побережье Лейте и доставили туда 10000 тонн грузов. Это было вдвое больше, чем они имели на этом острове 20 октября. Американцы высадили 101635 солдат, что было больше, однако японцы могли привлечь примерно 365000 солдат расквартированных по всем Филиппинским островам. Ситуация самым скверным образом напоминала то, что происходило на Гуадалканале 2 года назад. Мы выиграли крупный морской бой и обезопасили свои морские коммуникации. Однако мы не имели круглосуточного господства в воздухе и потому не могли помешать переброске подкреплений Токийским экспрессом.
Как только японское верховное командование перевело дух, оно начало перебрасывать самолеты на юг, на аэродромы Лусона, чтобы беспокоить войска 6 Армии, высаженные на берег, а также транспорты, постоянно приходящие и уходящие из залива Лейте. Хэлси загладил все свои ошибки героическими действиями после окончания морской битвы. Армейские инженеры никак не могли подготовить взлетные полосы на захваченных плацдармах, чтобы принимать армейские истребители. Они начали действия только в ноябре, и их было мало. Поэтому ОГ 38.2 адмирала Богана и ОГ 38.4 адмирала Дэвисона 29 — 30 октября атаковали аэродромный комплекс вокруг Манилы. В отместку камикадзэ врезались в авианосцы «Интрепид», «Франклин» и «Белло Вуд», причинив им такие тяжелые повреждения, что кораблям пришлось возвращаться на Улити. ОС 38 собралось там 1 ноября. Это был первый отдых для моряков и летчиков, которые начиная с 6 октября сражались почти непрерывно.
После ухода соединения Хэлси ситуация в воздухе над Лейте ухудшилась, так как войска и корабли остались под защитой горстки армейских самолетов, которую мог принять аэродром Таклобан. 1 ноября 1 эсминец был потоплен камикадзэ, а 3 были повреждены обычными бомбардировщиками. 5 ноября вернулось ОС 38 и в течение 2 дней наносило удары по аэродромам вокруг Манилы. Было уничтожено более 200 вражеских самолетов ценой 25 наших. Один камикадзэ врезался в «Лексингтон», но корабль серьезных повреждений не получил, хотя погибло 50 человек и было ранено 132. Эти усилия привели к значительному улучшению ситуации в воздухе над Лейте.
13 — 14 ноября Хэлси по срочному требованию МакАртура возобновил воздушные налеты на Лусон. На этот раз он нанес удар по кораблям, занимавшимся перевозкой подкреплений, и потопил 1 легкий крейсер, 4 эсминца и 7 транспортов. 25 ноября самолеты «Тикондероги» потопили в бухте Досол тяжелый крейсер «Кумано» и разгромили 2 прибрежных конвоя. После этого камикадзэ предприняли отчаянную контратаку. Поучили попадания авианосцы «Интрепид», «Кэбот» и «Эссекс», причем «Дурной И» — дважды. Погибло более 100 человек.