Реванш династии Чингиз-хана над династией Тамерлана больше не мог быть полным. В распрях, которые возобновились между двумя братьями – Ахмедом и Омаршейхом из-за обладания Ташкентом и Сайрамом, Юнус выступил как третейский судья, помирил их, заставив последних уступить ему эти два города (1484). [1271]
Именно в Ташкенте скончался в 1487 г. Юнус, удачно проведя реставрацию Чингизханидов. Ахмед попытался воспользоваться этим событием, чтобы отвоевать Ташкент у хана Махмуда, сына и преемника Юнуса, но потерпел поражение у этого города на Чире или Параке. Ташкент стал ставкой монгольского хана.
Тимуридский принц Ферганы – Омар Шейх (1469-1494), который властвовал только при поддержке чагатайских ханов Моголистана, умер 8 июня 1494 г. Его старший брат, правитель Трансоксианы – Ахмед сделал попытку тотчас же овладеть Ферганой, но умер около Уратепе в ходе военной кампании (июль 1494), а Фергана осталась во владении сына Омар Шейха – молодого Бабура, будущего «великого могола».
У Ахмеда остался брат по имени Махмуд и трое сыновей: Масуд, Байсонкар и Али, которые стали оспаривать друг у друга Трансоксиану. Им удалось только временно править Самаркандом. Махмуд (1494-1495), развратный тиран, умер в июле 1495 г. Масуд (1495-1499), по сведениям Мирхонда, правил в Самарканде, а по сведениям Бабура – в Гиссаре, во всяком случае, провел несколько месяцев царствования в военных действиях против своих братьев, пока не был лишен зрения одним из своих вероломных министров. Байсонкар (1495-1499), который какое-то время правил в Самарканде в те смутные времена, погиб некоторое время спустя от рук такого же врага, как и его брат. Их двоюродный брат – принц Ферганы – Бабур, будущий покоритель Индии, в то время совсем еще молодой – ему было только четырнадцать лет – воспользовался беспорядками, чтобы овладеть Самаркандом (конец 1497 г.), но не сумел там долго продержаться. Самарканд перешел во владение двоюродного брата Бабура по имени Али, последнего сына Ахмеда (1498). Но эти клановые разборки стали причиной внешнего вторжения. «Монгольский хан Мохаммед Шейбани, потомок старшей ветви Чингизханидов и предводитель орды узбеков, целеустремленно стремился обрести благополучие, овладев Трансоксианой. Он обосновался на северном берегу нижнего течения Сырдарьи и выжидал только удобного случая, чтобы переправиться через реку. Этот удобный случай предоставили ему непримиримые разногласия между тимуридами. В 1500 г. он вошел в Бухару и затем приблизился к Самарканду. Тимуридский правитель Али совершил непоправимую ошибку, согласившись на переговоры. Шейбани, выдавая себя за просвещённого монарха, сохранил привычки степного разбойника и умертвил простодушного юношу и занял престол Трансоксианы.