В ближайшие сутки штаб средиземноморской эскадры ожидал дальнейших инструкций из наркомата. Утром второго марта поступил приказ из наркомата: готовиться к эвакуации эскадры и расквартированного на Крите девятого особого стрелкового корпуса. Вечером третьего марта поступил другой приказ. Из Кремля. За подписью: Сталин.
Согласно этому приказу, в случае начала боевых действий против Германии и Италии, Крит следовало оборонять до последнего. Как говорили после войны, столь противоречивые приказы поступили по причине личного отсутствия первого марта в Москве наркома Кузнецова. Поэтому Сталин вызвал адмирала Исакова и, после консультации с ним, велел готовить эвакуацию. На следующий день с Дальнего Востока прилетел Кузнецов и имел длительный и жёсткий разговор со Сталиным. Кузнецов настаивал, Сталин колебался. В конечном итоге Сталин уступил жёстким доводам наркома, отменил своё прежнее распоряжение и продиктовал новое. Адмирала Исакова отправили командовать Каспийской флотилией. Позицию Турции осудили заявлением НКИДа, в генштабе достали старые, ещё царских времён, планы окончательного решения вопроса о проливах.
Недружелюбный запрет турок на прохождение проливов боевыми кораблями и судами с вооружением был принят под влиянием Германии. В этом никто не сомневался.
На тот момент в состав средиземноморской эскадры входили: крейсер «Ворошилов», лидеры «Ташкент» и «Новик», эсминцы «Сообразительный» и «Смышлёный», три подлодки типа «С», десяток судов снабжения. Согласно плану развёртывания советского флота, на этом театре на постоянной основе должны были присутствовать один крейсер, лидер, пять эсминцев и пять подлодок. Сухопутные войска были представлены 106-й и 156-й стрелковыми бригадами, входившими вместе с частями обеспечения в состав девятого особого корпуса. Корпусом командовал генерал-лейтенант Батов. Обе бригады были укомплектованы опытными командирами и бойцами, ветеранами Халхин-Гола и Ирака. К сожалению, до сих пор не был решён вопрос базирования на Крите военно-воздушных сил. Продолжалось строительство полевых аэродромов, но советские авиачасти на остров ещё не прибыли.
В складывающейся ситуации у советских войск оставался единственный реальный путь эвакуации: через контролируемую французами Сирию. Морской путь эвакуации через всё Средиземное море являлся крайне опасным по причине активных боевых действий в Алжире между немцами, французами и итальянцами. За один месяц присутствия в Африке германских сухопутных сил генерал Роммель захватил практически весь Алжир. Сейчас немцы взяли в осаду Оран. Самолёты десятого германского авиакорпуса царили над полем боя. Французский флот был вынужден оставить западное Средиземноморье. И даже атлантическое побережье Марокко. Сухопутные силы Заморской Франции терпели одно поражение за другим. Тандем Роммеля и фон Рихтгофена был способен бросить к ногам Гитлера всю северную Африку. Подвели итальянцы.