Шестнадцатого апреля страны Тройственного союза потребовали от советского правительства прекратить оказание военной помощи греческой стороне. В противном случае Берлин, Рим, Будапешт и к ним примкнувшие грозили разорвать дипломатические контакты с Советским Союзом. В тот же день советский 6-й казачий кавалерийский корпус двинулся на Багдад. Вслед за ним на иракскую территорию вошли 6-я, 32-я, 36-я кавалерийские дивизии. Действующий из бухты Суда греческий флот понёс первые боевые потери: пикировщики Ю-87 потопили небольшой крейсер «Елли» и серьёзно повредили, вынудив выбросится на берег, эсминец «Василиса Ольга». Следует отметить, что на «Елли» погибло более сотни гражданских беженцев, которых крейсер вывозил из разбомбленного Люфтваффе порта Пирей. Кроме этих военных кораблей, немцы потопили с десяток невооружённых гражданских пароходов.
Семнадцатого апреля окружённые немцами на севере страны греческие войска стали сдаваться в плен. Генерал Георгиос Цолагоглу подписал акт о капитуляции подчинённых ему войск. Премьер-министр Александрос Коризис объявил об эвакуации правительства страны и при загадочных обстоятельствах покончил с собой. По официальной версии — застрелился в собственном кабинете. В данной ситуации скорость продвижения германских войск дальше на юг ограничивалась только рельефом местности. Германские пикировщики занесли на свой счёт ещё три небольших греческих миноносца и четыре гражданских судна, а итальянский миноносец «Антарес» у побережья Албании таранным ударом потопил подлодку «Протеус».
Восемнадцатого апреля германский посол граф фон Шуленбург отбыл в Берлин для консультации со своим правительством. Греческий король Георг со своей семьёй был эвакуирован на Крит советской летающей лодкой «Ра-3». После длительных переговоров с греческими и советскими военными король провёл перестановки в правительстве и назначил генерала Папагоса новым премьер-министром страны. Главнокомандующим вооружёнными силами стал адмирал Сакеллариу. На следующий день греческий монарх улетел в Бейрут. Туда же, на крейсере «Аверов», отправились вновь назначенные члены правительства и другие бесполезные на острове персоны. Крейсер включили в состав формируемого каравана транспортных судов, отправлявшегося к берегам Ливана. На переходе в Бейрут греческий караван атаковала итальянская подводная лодка «Дельфино». Скорее всего, целью подводников Супермарины являлся флагман греческого флота. Вместо него подводники поразили эсминец «Леон». Итальянская торпеда оторвала кораблю корму, после чего греки затопили потерявший ход корабль. К счастью, новых атак итальянских подводников не последовало. Командиры итальянских подлодок опасались возможных атак со стороны часто пролетавших над данной частью Средиземного моря советских самолётов. Хотя официально страны и не находились в состоянии войны, никто не питал иллюзий о мирном разрешении конфликта.