Государственные посты заняли военные, действующие под полным контролем Стресснера. На все гражданское управление распространились военные методы руководства. Была проведена политизация вооруженных сил: все военнослужащие обязаны были вступить в партию «Колорадо». Саму партию Стресснер милитаризовал, придав ей жесткую иерархическую структуру. Преданность армии обеспечивалась вовлечением офицеров в нелегальную экономику – контрабанду наркотиками, алкогольными напитками, машинами, предметами роскоши, приносящую больше доходов, чем внешняя торговля страны. Кроме того, Стресснер лично следил за всеми перемещениями в армии – от младшего лейтенанта до начальника главного штаба. Охрану диктатора осуществляло свыше 2 тыс. человек. Сюда входил полуторатысячный «батальон охраны», обладавший такой же огневой мощью, как и вся остальная армия. По его образу и подобию были созданы «полицейский батальон безопасности» в количестве 400 человек и секретная полиция.
Основными чертами диктатуры стали коррупция и взяточничество. Этим занимались все официальные лица, включая и президента. Плату брали за все: за контрабанду, за сделки с транснациональными корпорациями, за вид на жительство, за предоставление гражданства. Большая часть прибыли шла в сейфы Стресснера и высших офицерских чинов, находившихся за границей. Сам диктатор стал крупнейшим латифундистом. Не были забыты и его родственники. Сыновьям Густаво и Альфредо принадлежали гигантские бойни-холодильники и другие прибыльные предприятия. Зять владел электростанцией. Кроме того, семейство Стресснеров контролировало всю сеть игорных заведений страны. Всеми административными ведомствами руководили доверенные лица диктатора, которые, составляя вместе с его семейством едва 4 % населения, присваивали себе половину национального дохода.
С момента прихода Стресснера к власти на страну обрушились террор и репрессии. При том, что население Парагвая чуть превышало 3 млн человек, через тюрьмы прошли почти 400 тыс., эмигрировало более 1,5 млн. А сколько людей погибло под пытками, пропало при похищениях и карательных рейдах определить невозможно. На долгие годы страной завладел страх, парализующий волю к протесту. Контроль над страной и надзор за населением осуществлял не только репрессивный аппарат, но и партия «Колорадо», входившая в структуру гражданской гвардии.
Почти на всем протяжении правления Стресснера надежным партнером режима выступали США, получившие разрешение на строительство в стране военных баз и оказывавшие Парагваю многомиллионную финансовую помощь. В благодарность диктатор провозгласил Парагвай «лучшим другом Соединенных Штатов» и поддерживал их политику в ООН и в ОАГ. Когда в 1965 г. американский президент Джонсон решил затопить кровью Доминиканскую республику, Стресснер послал в Сант-Доминго в помощь США свои войска, которыми командовал бразильский генерал П. Алвим. Прекрасные отношения Парагвай поддерживал и с военными правительствами соседних государств – Бразилии, Аргентины, Боливии, Чили.