С апреля 2005 года был федеральным комиссаром молодежного движения «Наши», в октябре 2007 года стал главой Госкоммолодежи. Тогдашний премьер-министр Владимир Путин назначил Якеменко руководителем «Росмолодежи», которое позже появилось на базе «Госкоммолодежи».
ЛИЧНОЕ ДЕЛО
(из базы данных «Просопограф» политолога Владимира Прибыловского)
В марте 2000 г. был организатором манифестации проституток в защиту уволенного генпрокурора Юрия Скуратова.
С марта по май 2000 года был руководителем отдела по связям с общественными организациями управления внутренней политики Администрации Президента РФ.
В мае 2000 года создал организацию «Идущие вместе».
Выступал за запрещение книг Пелевина, Ерофеева, Сорокина, против группы «Руки вверх», «Ласкового мая», Газманова.
15 апреля 2005 провел на ВВЦ в Москве первый съезд прокремлевского молодежного движения «НАШИ», в котором приняли участие около 700 комиссаров и сторонников Движения более чем из 45 городов России и стран бывшего СССР.
В октябре 2005 г. в интервью «Комсомольской правде» впервые употребил термин «суверенная демократия».
15 апреля 2006 переизбран в Федеральный совет движения «Наши».
8 октября 2007 года назначен председателем Госкомитета по делам молодежи.
С мая 2008 г. – Руководитель Федеральной службы по делам молодежи (в составе Министерства по делам спорта, молодежи и туризма; министр – Виталий Мутко).
В конце мая 2012 года стало известно, что Якеменко намерен заняться новым политическим проектом – созданием «Партии власти», не связанной с движением «Наши». Целью партии, по его словам, станет проведение реформ, в которых нуждаются «люди будущего» – молодежь из разных социальных слоев в возрасте 25–30 лет.
Партия Якеменко будет критиковать власти, но с небольшим отступлением – неприкасаемым останется президент Владимир Путин, утверждали в окружении чиновника. Главная цель Якеменко – не дать молодежи в регионах подпасть под влияние оппозиции.
«Это будет идеология в духе «Путин в кольце врагов». То есть будут лояльны президенту, а вот остальных, особенно на региональном уровне, будут жестко критиковать», – рассказал собеседник из окружения основателя прокремлевского движения «Наши».
Над проектом помимо самого Якеменко работают лидер сворачиваемого проекта «Наши» Никита Боровиков, председатель комиссии по делам молодежи в Общественной палате Мытищинского муниципального района Евгений Акимов и депутат Совета депутатов Мытищинского района Иван Петрин.
Пока есть два рабочих варианта названия партии: «Умная Россия» и «Единая неделимая». О том, что движение «Наши» закроют или реформируют, СМИ писали давно. Федеральный комиссар «Наших» Мария Кислицына опровергла эти слухи, отметив, что должен состояться ежегодный съезд движения, который, как утверждали источники, и окажется съездом новой партии.