К 90-м годам XVIII в. В. А. Левшин стал тяготеть к исследованиям экономического и исторического характера. В этих областях он был как активным переводчиком, так и создателем оригинальных произведений.
В 1791 г. В. А. Левшин избран корреспондентом Вольного Экономического общества, спустя два года — в 1793 г. стал его членом, а позднее непременным секретарем и непременным членом комитета Общества. В. А. Левшин внес значительный вклад в деятельность Общества своими экономическими сочинениями и прежде всего «Топографическим описанием Тульской губернии», которое до настоящего времени является, по определению специалистов, одним из лучших топографических описаний из всех существующих описаний губерний. В. А. Левшин был пионером геологических разведок на территории Белевского уезда. Он принимал активное участие в изучении края: писал собственные сочинения, помогал другим исследователям, например, профессору Московского университета ф. Г. Дильтею в составлении «Топографического описания Тульского наместничества», которое было опубликовано в 1781 г.
За оригинальное решение экономических задач, предлагавшихся Вольным Экономическим обществом, В. А. Левшин получил от него 17 золотых и четыре серебряных медали, кроме того, ему было пожаловано от царского имени пять бриллиантовых перстней. Являясь членом Вольного Экономического общества, В. А. Левшин был в курсе исследований А. Т. Болотова, агронома И. М. Комова, известного ученого XVIII в. А. А. Нартова. В конце XVIII — начале XIX вв. членами Вольного Экономического общества были известный политический деятель М. И. Голенищев-Кутузов, адмирал А. И. Синявин, поэт Г. Р. Державин.
Помимо Вольного Экономического общества, В. А. Левшин с 1809 г. был членом Общества испытателей природы при Московском университете, почетным членом Вольного общества любителей словесности, наук и художеств (с 1818), Московского общества сельского хозяйства (с 1821).
Заслуги В. А. Левшина в изучении хозяйства и экономики, в распространении в России достижений европейских ученых сделали его имя широко известным: в 1795 г. он был избран почетным членом королевского Саксонского экономического общества, в 1806 г. — членом Итальянской Академии наук.
В. А. Левшин был бескорыстным ученым и литератором. Его творческая работа, принося автору радость познания и минуты вдохновения, не могла служить источником большого дохода. В 1798 г., как раз после написания и издания его комических опер и замечательного перевода «Слуги двух господ» Гольдони, долг «титулярного советника В. А. Левшина составил 1800 рублей с залогом имения — села Темряни Белевского уезда и села Троицкого Одоевского уезда». Эти трудные обстоятельства заставили В. А. Левшина в 1799 г. обратиться к влиятельному родственнику князю П. В. Лопухину с просительным письмом. «Мне почти 60 лет, в семействе моем сам двенадцатый, имение малое, которое по малоземелью не токмо не приносит столько дохода, чтоб мог я прилично дворянину себя содержать, но не доставляет оного на проценты», — писал В. А. Левшин. В письме содержалась просьба помочь ему «в старости, имеющему десять детей, в том числе пять дочерей, ожидающему и с ними остаться без пропитания». Прошение имело княжескую резолюцию: «Пусть терпит».