Барон Фридрих Вильгельм Генрих Александр фон Гумбольдт был прозван современниками Аристотелем XIX века.
Наряду с множеством открытий во всех естественных науках фон Гумбольдт является основоположником физической и ботанической географии, изучения геомагнетизма, климатологии, он первым ввёл в науку понятие «сферы жизни», обозначив всё живое на планете, позже этот термин получил иное название – биосфера.
На географических картах имя Александра фон Гумбольдта носит множество объектов. В Северной Америке – горы и заповедник Гумбольдта, река и лес, солончак, пик в Неваде, пик на хребте Сангре де Кристо на севере штата Колорадо, залив и пик в Калифорнии, город Гумбольдт Хилл, 2 природных парка Гумбольдт Лагунз и Гумбольдт Редвудз на севере Калифорнии; 12 городов в штатах Айова, Невада, Аризона, Иллинойс, Канзас, Миннесота, Небраска, Южная Дакота, Теннесси и Висконсин; Мичиган, район Гумбольдт-парк в Чикаго, ледник в Гренландии, течение в Тихом океане, горный хребет в Центральной Азии, горы в Китае, Австралии, Новой Гвинее, Новой Зеландии, город в провинции Саскачеван в Канаде, пик в Венесуэле, лес в Перу, пояс растительности в Андах, Национальный парк на Кубе, гора Гумбольдта в южной части Северного Урала.
Дагеротипия ок. 1850 г., <Херманн Биоу>
В животном царстве в честь Гумбольдта названы следующие виды: дельфин (Inia geoffrensis humboldtiana), кальмар (Dosidicus gigas), большеухий кожан (Histiotus humboldti), шерстистая обезьяна (Lagothrix lagotricha), пингвин (Spheniscus humboldti), прилипала (Catostomus occidentalis humboldtianus), саймири (Saimiri sciureus cassiquiarensis), скунс (Conepatus humboldtii).
В растительном – Гумбольдтара (Humboldtara) и орхидея (Phragmipedium humboldtii), Гумбольдтия (Humboldtia) и Гумбольдтиелла (Humboldtiella) из семейства бобовых. Кроме того Ботанический номенклатурный справочник Index Kewensis, издаваемый английскими Королевскими ботаническими садами Кью, включает 321 вид растений, названных в честь Гумбольдта, среди них ива (Salix humboldtiana), пузырчатка (Utricularia humboldtii), дуб (Quercus humboldtii), кремовое яблоко (Annona humboldtii), лилия (Lilium humboldtii) и др.
В космосе в честь Александра фон Гумбольдта названы астероид и море на Луне.
В честь Александра фон Гумбольдта были названы следующие учебные заведения: Университет Гумбольдтов в Берлине, Международная немецкая школа имени Гумбольдта в Монреале, Институт тропической медицины имени Гумбольдта в Университете Кайетано Эредиа (Лима), Университет имени Гумбольдта в городе Арката (Калифорния), Высшая школа имени Гумбольдта в Сент-Поле (Миннесота).