15 июня 2006 г. боевики убили 64 сингалов — пассажиров автобуса, ответом стали новые воздушные рейды. 26 июля ВВС правительства нанесли массированные удары по военным лагерям «тигров», что считается в ряде источников датой официального начала четвертой войны. Наземные боевые действия возобновились в июле, когда силы ТОТИ перекрыли шлюзы водохранилища Мавил Ару, оставив без воды обширный район. Правительственные войска приступили к операции по деблокированию шлюза и после ожесточенные боев 15 августа овладели районом водохранилища.
2 августа силы ТОТИ захватили город Муттур, отбитый армией уже 5 августа. А 11 августа 2006 г. «тигры» начали наступление на «главном фронте» — полуострове Джафна, хотя не смогли добиться здесь значительных успехов. Тем временем 4 сентября ланкийские войска смогли выбить «тигров» из важного района Сампур, откуда силы ТОТИ могли угрожать важной ланкийской военно-морской базе Тринкомали. В октябре ВМС «тигров» предприняли массированные нападения катеров-камикадзе на корабли ланкийского флота.
Два вектора наступления
Полагая, что позиции ТОТИ на востоке острова после восстания Кару-на значительно ослабли, командование ланкийской армии разработало план боевых действий, предусматривающий сосредоточение основных усилий в восточной части страны и после очищения ее от «тигров» перенос кампании на север. В соответствии с этим планом армия развернула наступление на оплот ТОТИ на востоке — 19 января 2007 г. город был взят, а 28 марта войска овладели городом Коккадичолай. 12 апреля армия заявила о полном взятии под контроль стратегического шоссе А5 на востоке острова — эта дорога не контролировалась правительством 15 лет. К июлю 2007 г. основные регионы на востоке Шри-Ланки перешли под власть правительства.
Боевые действия в северной части острова начали сами «тигры». В августе 2007 г. силы ТОТИ пытались отвоевать анклавы у ланкийской армии на полуострове Джафна. Атаки производились стремительно, в сочетании с высадками морских десантов и при мощной артиллерийской поддержке. Первоначально «тиграм» сопутствовал успех, однако в итоге их наступление захлебнулось на хорошо выстроенных армией линиях обороны. Тем временем правительство Шри-Ланки наращивало армейские группировки на севере и с сентября 2007 г. приступило к методичному отвоеванию территории. Перелом наступил в конце года. 22 декабря армия захватила ряд опорных пунктов ТОТИ на полуострове Джафна, а 29 декабря взяла оплот «тигров» в провинции Маннар — город Параппакандал. 2 ноября в результате авианалета была убита глава политического крыла ТОТИ Тамилселван, а в результате удара авиации 27 ноября был серьезно ранен лидер «тигров» Прабхакаран.