С-45 сперва служили только на территории США, а затем постепенно распространились по всем театрам боевых действий. На них перевозили запасные части, медикаменты, продовольствие, боеприпасы, использовали как самолеты связи, эвакуировали раненых и больных. Зачастую по одному-два С-45 придавали авиационным частям и соединениям.
Великобритания получила по ленд-лизу 416 «Экспедиторов». Сначала их использовали как учебные для подготовки летчиков двухмоторных самолетов, а с 1943 г. на Цейлоне, еще позже в Индии и Бирме как самолеты связи. Некоторое количество машин эксплуатировалось в этой роли и в самой Великобритании. «Экспедиторами» располагали как RAF, где они служили до 1946 г., так и морская авиация, которая после войны приобрела еще 25 машин.
Канада купила в США шесть машин гражданских модификаций А18, В18, В18S и D18, а затем по ленд-лизу получила еще 28 штук. Канадские «Экспедиторы» работали только на своей территории как учебные и связные самолеты.
В 1941 г. один гражданский «Бичкрафт» приобрела «Свободная Франция» генерала де Голля. Он базировался в Дуале (Камерун). Позже американцы поставили по ленд-лизу 25 транспортников UC-45F. Французы применяли «Экспедиторы» с лета 1944 г. в Северной Африке, затем на фронте в южной части Франции и в Германии.
По программам военной помощи такие самолеты получили многие страны Латинской Америки. С августа 1942 г. они состояли на вооружении в Бразилии (12 машин), с июля 1943 г. – в Мексике (3), с июня 1944 г. – в Колумбии (11 UC-45F). В январе 1945 г. один С-45 разбили при перегонке в Чили, вскоре его заменили другим таким же. На Кубу в апреле того же года поставили один UC-45F и один F-2B. В мае 1945 г. два UC-45F достались авиации Парагвая.
Параллельно с транспортниками в Уичите в больших количествах собирали военные учебно-тренировочные самолеты АТ-7 «Навигэйтор» и АТ-11 «Кансан». Они предназначались для подготовки членов экипажей бомбардировочной и разведывательной авиации: пилотов, штурманов, бомбардиров, радистов и воздушных стрелков.
АТ-7 служил для подготовки штурманов. Внутри его салона располагались два рабочих места курсантов с необходимым оборудованием. Приемы астронавигации отрабатывали под большим блистером, установленным сверху кабины. Таких машин, оснащенных моторами R-985-25, выпустили 577. Кроме того, построили 6 поплавковых АТ-7А, 9 «зимних» АТ-7В, способных эксплуатироваться в условиях сильных морозов, и 549 экземпляров АТ-7С с моторами R-985-AN3.
АТ-11 предназначался для обучения бомбардиров и воздушных стрелков. Он имел остекленную носовую часть фюзеляжа с кабиной бомбардира, нес бомбовое и стрелковое вооружение. Большие прямоугольные окна салона у него были заменены на маленькие круглые. На первых 150 самолетах устанавливали верхнюю турель «Бичкрафт» с одним 12,7-мм пулеметом М2, далее вместо нее ставили турель «Крокер-Уилер» с двумя М2, а третий пулемет разместили в нижней люковой установке шкворневого типа. ВВС армии США получили 1582 АТ-11 и еще 24 самолета изготовили по заказу эмигрантского правительства Нидерландов для летной школы в Джексоне. Позже 36АТ-11 переделали в вариант для обучения штурманов, названный АТ-11А.