На органы госбезопасности были возложены также контроль за технологическим состоянием промышленных, прежде всего оборонных объектов, эффективностью их деятельности, выявление причин невыполнения планов, выпуска некачественной продукции и т. п. Ими было налажено систематическое информирование по этим вопросам партийных и государственных инстанций разного уровня.
В 1939—1940 гг. пограничные войска были выдвинуты на линию новой государственной границы. Кроме того, они охраняли зону заграждения по линии старой границы, участвовали в поддержании режима безопасности на присоединенных территориях, вели борьбу с бандитскими и диверсионно-террористическими формированиями.
Пограничные войска активно добывали разведывательную информацию о военных приготовлениях фашистской Германии, задерживая и выявляя вражеских агентов среди нарушителей границы. Масштабы этой работы и ее результаты видны из приведенных в спецсообщениях НКВД СССР в ЦК ВКП(б) и СНК СССР данных о нарушениях государственной границы СССР со стороны Германии с ноября 1940 г. по 10 июня 1941 г.
Возрастание военной опасности и предпринимавшиеся Политбюро ЦК ВКП(б) и советским правительством в связи с этим меры требовали изменений и уточнений мобилизационных планов. 25 сентября 1939 г. был издан приказ НКВД СССР о разработке агентурно-оперативных мероприятий на военное время и составлении оперативно-мобилизационных планов [161] . Особенно активно эта работа развернулась с лета 1940 г., когда стали выявляться многочисленные факты подготовки Германии к агрессии против СССР. Разработка мобилизационных планов осуществлялась также в органах государственной безопасности и в пограничных войсках. [162]
В целях обеспечения координации разведывательной и контрразведывательной деятельности органов госбезопасности, погранвойск, НКО и НКВМФ 29 мая 1941 г. при НКГБ СССР был создан Центральный совет по координированию оперативной и следственной работы органов НКГБ, 3-го отдела НКВД и 3-х Управлений НКО и НКВМФ.
В условиях сложной предвоенной обстановки совершенствовалась специальная подготовка оперативного состава. С августа 1939 г. была введена обязательная оперативно-чекистская учеба всех оперативных работников органов госбезопасности, организована подготовка оперативных работников со знанием немецкого и английского языков, принято решение о зачислении в кадры органов госбезопасности и о специальной подготовке оперативных работников из поляков, румын и чехов, о подготовке шифровальщиков на военное время. Предпринимались и другие меры обеспечения органов государственной безопасности кадрами на случай возникновения войны.