Одновременно в составе формирующейся Красной Армии создавалась своя разведка.
Двадцать шестого января 1918 года Коллегией ВЧК было принято решение о ликвидации старорежимной контрразведки, а двум ответственным товарищам было поручено опечатать сейфы с оперативными делами этой службы. В решении также говорилось о создании новой советской военной разведки и контрразведки.
С мая 1918 года всей агентурной и войсковой разведкой на территории РСФСР ведал Оперативный отдел (Оперод) Народного комиссариата по военным делам (Наркомвоен). Правда, за 2 месяца до этого, 17 марта 1918 года был утвержден штат Высшего военного совета (ВВС). В нем в числе прочих была предусмотрена должность помощника генерал-квартирмейстера по оперативной части и разведке. Наряду с Оперодом, Военному совету также было предписано заниматься военной разведкой. Но что примечательно, параллельно с этими двумя структурами продолжал функционировать Отдел 2-го генерал-квартирмейстера, осуществлявший военную разведку еще при царском режиме. Этот отдел до революции входил в Главное управление Генерального штаба (ГУГШ), а впоследствии влился в Наркомвоен молодой республики.
В начале мая того же года, на базе ГУГШ Народного комиссариата по военным делам был создан Всероссийский главный штаб и преемником 2-го отдела стал Воен-но-статистический отдел, фактически полностью сохранив структуру 2-го отдела. После создания штаба Революционного военного совета республики (путем слияния ВВС и Оперода) в нем появился разведотдел и разведотделение. Но полностью это не устранило децентрализацию армейских разведорганов. И вот 14 октября 1918-го Реввоенсовет издал приказ об осуществлении руководства всеми органами Военного контроля и агентурной разведкой Полевым штабом РВС республики. 1 ноября 1918 года был утвержден штат Полевого штаба РВС, а 5 ноября 1918 года издан соответствующий приказ, согласно которому в состав шести сформированных управлений вошло и Регистрационное управление (Региструпр) — центральный орган военной разведки Красной Армии. Вот почему 5 ноября считается днем основания советской военной разведки, впоследствии Главное разведывательной управление (ГРУ).
После окончания Гражданской войны Советская власть возложила на спецслужбы, помимо ведения разведки за рубежом, борьбу с белой эмиграцией за границей, а также подготовку и обеспечение «революционных ситуаций» в буржуазных странах. В связи с этим количество закордонных работников резко возросло. Изменились и методы работы. Первый случай предательства кадрового сотрудника Разведуправления РККА Смирнова произошел в 1924 году.