Среди группировок, перешедших в Пакистан, была «Хезб-и-Ислами» во главе с Гульбеддином Хекматиаром. После терактов сентября 2001 г. Хекматиар открыто заявил о сотрудничестве с «Аль-Каидой» и «Талибаном» в борьбе против «крестоносцев» в Афганистане >49. Группировка Хекматиара, имевшая в своем составе несколько сотен боевиков, имела своей целью свержение правительства Афганистана. Сам Хекматиар рассчитывал стать во главе государства. Зона действия группировки включала Северо-Западную пограничную провинцию Пакистана и северную часть Зоны племен, а также афганские провинции Нуристан, Кунар, Лагман и Нангархар >50. Хекматиар время от времени заигрывал с правительством, но, по данным Евросоюза и ООН, ему «периодически предлагали деньги от имени «Талибана» для пополнения его пустых чемоданов» и он «согласился не вступать более в переговоры с правительством Афганистана»>51.
Кроме группировки Хекматиара, в Пакистане начали перевооружение боевики крыла «Хезб-и-Ислами», которое возглавлял Юнус Халес. Один из сыновей Халеса, Анвар аль-Хак Моджахед, собрал под свои знамена группу боевиков «Хезб-и-Ислами», недовольных пуштунов и некоторых бывших членов «Талибана». То же самое сделала группировка под названием «Техрик-и-Нафаз-и-Шариати-Мохаммади» (Движение за соблюдение шариата. – Прим. пер.) во главе с Суфи Мухаммедом, целью которой было установление законов шариата на всей территории Афганистана и Пакистана силой, если это будет необходимо. Когда в 2001 г. режим «Талибана» начал рассыпаться, он призвал и организовал тысячи людей на борьбу против Соединенных Штатов и сил Северного Альянса. Однако группировка была запрещена Первезом Мушаррафом, а Суфи Мухаммед в 2002 г. оказался за решеткой. Тем не менее, благодаря неустанным усилиям пользовавшегося большим влиянием приемного сына Суфи Мухаммеда, муллы Фазлуллы, известного длинными волосами, группировка продолжала развиваться. Фазлулла имел прозвище «Радио-мулла» из-за радиопередач, которые вела подконтрольная ему пиратская FM радиостанция.
Имелся также ряд группировок, которые базировались и перевооружались в Зоне племен. (Федерально управляемых племенных территорий) существует семь агентств (Хайбер, Куррам, Оракзай, Моманд, Баджаур, Северный Вазиристан и Южный Вазиристан). Имеется также шесть пограничных регионов: Пешавар, Кохат, Банну, Дера Исмаил-Хан, Танк и Лакки Марват. Пуштунские племена, контролировавшие этот регион, сопротивлялись колониальным властям с решимостью, не имевшей параллелей на всем субконтиненте. Они добились максимальной автономии и разрешения вести свои дела в соответствии с исламскими законами, обычаями и традициями. Британцы предоставили старейшинам племен, которых называли «малик», особые права в обмен на поддержание мира, сохранение свободного проезда по дорогам (например, Хайберского перевала) и арест преступников. После разделения Британской Индии в 1947 г. Пакистан сохранил систему местной автономии и особых прав.