После назначения главой спецслужб Беери не оставил своих привычек. Он сразу же с рвением взялся за выявление предателей в собственных рядах. Надо сказать, понятие «предатель» в Хагане трактовали очень широко. Так, например, еврейская женщина, вступавшая в связь с англичанином, считалась предательницей и могла быть казнена без суда и следствия. Вскоре Беери подвернулся прекрасный повод для того, чтобы продемонстрировать свои способности. Капитан Меир Тубянски являлся одним из ветеранов «Хаганы». Это был веселый и общительный человек, на счету которого, тем не менее, накопилось немало заслуг. В частности, он вел разведывательную деятельность среди британских военных и добывал множество ценной информации, которую другими путями было бы просто не достать. Естественно, это требовало установления особо доверительных отношений с британцами. Тубянски часто встречался с английскими офицерами, неоднократно участвовал в их дружеских попойках.
Но годы британского господства закончились, началась гражданская война. В нее тут же вмешались окрестные арабские государства. Армией одного из них, Иордании, командовали английские офицеры, в недавнем прошлом друзья Меира. С некоторых пор командиры «Хаганы» стали отмечать невероятную точность иорданской артиллерии: она всегда била по подразделениям молодой израильской армии так, как будто четко знала об их местонахождении. Ни один самый засекреченный маневр не удавалось скрыть. Естественно, это навело руководство Израиля на мысль о шпионе. Бен-Гурион лично вызвал к себе Беери и устроил ему разнос. Глава спецслужбы, который не мог вынести подобного позора, тут же развил бурную деятельность. Схватили первого попавшегося, им оказался Тубянски, и тут же припомнили ему и попойки с британскими офицерами, и дружеские отношения администрацией. Никто даже не задался вопросом, откуда капитан получает информацию, причем такую полную и оперативную, и каким образом переправляет ее через линию фронта. Суда как такового не было, Меира фактически тут же линчевали, так и не дав ему ничего сказать в свое оправдание. Говорят, перед смертью капитан попросил: «Я двадцать два года прослужил в „Хагане“, позвольте мне хотя бы написать письмо сыну». Но даже этого ему не разрешили.
Спустя несколько недель выяснилось, что Тубянски ни в чем не виновен. Его вдове принесли извинения и постарались побыстрее замять неудобное дело. Но тут же начали новое, против Иегуды Амстера, обычного частного предпринимателя. Амстер жил в Хайфе и являлся владельцем небольшой фирмы, занимавшейся услугами такси. В его распоряжении находилось всего несколько такси. Наверное, Иегуда был бы совершенно ничем не интересен Иссеру Беери, если бы не одно обстоятельство: он являлся другом детства тогдашнего мэра Хайфы Аббы Коуши. Коуши подозревали в связях с криминалом, но это, простите за тавтологию, было еще не самое криминальное в глазах радикальных сионистов. Дело в том, что мэру удавалось поддерживать в многонациональной Хайфе мир и порядок довольно необычными для тех мест методами — он старался проводить как можно более мягкую политику, сглаживать, а не обострять противоречия. Руководители Израиля, в первую очередь сам Бен-Гурион, считали это дурным примером. Арабов надо уничтожать, а не мириться с ними! Чтобы получить компромат на мэра Хайфы, Беери хватает его друга и бросает в тюрьму.