Тем временем 1-я и 3-я эскадрильи продолжали совершать боевые вылеты. 1 сентября третью безвозвратную потерю понесла 3.(F)/Ob.d.L. Из вылета в район Севастополя не вернулся Ju-88B «K9+QM» фельдфебеля Герхарда Таплика (командир экипажа штурман обер-лейтенант Йоханнес Рунке). Данная модификация разведчика являлась экспериментальной, отсюда и необычный бортовой код. Она имела необычное остекление кабины и была оснащена двигателями BMW 801МА мощностью 1560 л. с. Разведчик обладал значительно большей, чем обычные Ju-88, максимальной скоростью – 540 км/ч и мог летать на высоте до 9000 м. Несколько Ju-88B, в том числе пропавший W.Nr. 024, проходили боевые испытания в группе Ровеля. Что стало причиной потери разведчика – неизвестно.
Через две недели, 16 сентября, уже в результате налета советских бомбардировщиков на аэродром Николав, куда только что перебазировалась эскадрилья, прямым попаданием был уничтожен Do-215 W.Nr. 074.
Крым имел важнейшее стратегическое значение. Огромный полуостров, который с материком соединялся только узким перешейком в северной части, обеспечивал контроль за акваторией Черного моря. Через него проходил один из путей к нефтеносным районам Кавказа (через Керченский пролив и Тамань). Кроме того, Крым был важен как база для авиации. С потерей полуострова советская авиация лишилась бы возможности наносить авиаудары по нефтепромыслам Румынии, а немцы, наоборот, могли начать наносить удары по целям на Кавказе. Советское командование понимало важность удержания полуострова и бросало туда все имеющиеся силы. 12 сентября передовые немецкие подразделения вышли к Перекопскому перешейку, фактически отрезав Крым с суши. Затем начались упорные бои за сам полуостров, продолжавшиеся с переменным успехом до конца года.
В задачи 3-й эскадрильи входили наблюдение за передвижениями советского Черноморского флота, аэрофотосъемка его баз и путей снабжения, а также аэродромов ВВС ЧФ.
29 сентября во время боевого вылета над Черным морем пропал без вести Do-215 «T5+HL» фельдфебеля Хельмута Фризе[46]. При этом командир экипажа штурман обер-лейтенант Август Вульфмайер погиб, а остальные три летчика попали в плен. Таким образом, в течение месяца подразделение лишилось трех самолетов и двух экипажей.
Октябрь стал для 3-й эскадрильи чуть более удачным. 18 октября в очередной разведывательный вылет над Черным морем отправился Do-215 «T5+LL» лейтенанта Петерсена (командир экипажа штурман лейтенант Остервальд). В этот день в районе Севастополя в воздухе дежурила пара истребителей МиГ-3 из 32-го иап ВВС ЧФ. Ведущим был тот самый капитан Евграф Рыжов, который тремя месяцами раньше уже таранил над морем «Дорнье» Бернарда Грайхена. Ведомым Рыжова был старший лейтенант Николай Савва. Во время патрулирования летчики сначала увидели длинный инверсионный след, а затем и идущий на высоте около 6000 м самолет. Приблизившись к нему, Рыжов опознал цель как «бомбардировщик До-215». Уже имея опыт встречи с таковыми, ведущий первым начал атаку. Однако бортстрелок унтер-офицер Херманн своевременно открыл огонь из пулемета и добился многочисленных попаданий в перехватчик. На сей раз Рыжов даже не мог пойти на таран. Ему пришлось отвернуть и идти на вынужденную посадку в сторону берега.