В юго-западной части страны наиболее крупной рекой является Гильменд, имеющая длину 1150 км, ширину от 90 до 350 м, глубину 1–2 м и скорость течения 1–2 м/с.
В восточной части страны протекает река Кабул с многоводным левым притоком Кунар, которая в районе Джелалабада имеет ширину до 200 м и глубину 5–7 м.
Все афганские реки, за исключением Амударьи, значительную часть года проходимы вброд, однако представляют собой серьезные водные преграды в период паводков.
Растительный покров Афганистана хотя и не обилен, но достаточно разнообразен. Лесами занято менее 5 % территории страны. На высотах от 1500 до 1800 м преобладают засухоустойчивые виды растительности: астрагалы, верблюжья колючка и др. В пустынях растут полынь, солянки и саксаул. В районах, приграничных с Пакистаном, имеется небольшая площадь лесов гималайского типа. Здесь на высоте до 2500 м растут вечнозеленые дубы, а на высоте до 3300 м — сосны, пихты и кедры. Выше располагаются криволесье и альпийские луга.
Климат страны субтропический, резко континентальный, засушливый со значительными суточными и годовыми колебаниями температуры воздуха. Самый жаркий месяц на большей части страны — июль, когда среднемесячная температура колеблется от 30 до 50 градусов по Цельсию. Максимальный нагрев открытой поверхности земли летом достигает 70 градусов. Самый холодный месяц — январь, а в горах местами — февраль, когда среднемесячная температура опускается до минус 2–14 градусов. Глубина снежного покрова в конце зимы на равнинах и в долинах составляет 10–15 см, а в горах нередко достигает 2 м. Часто бывают метели продолжительностью до нескольких суток.
В горных долинах господствуют сильные ветры, особенно в пределах горного участка дороги Термез — Кабул, скорость их достигает 50 м/с. На вершинах гор и перевалах часто возникают шквальные ветры большой силы.
В столь сложных физико-географических условиях проведение классических операций и боев, предусмотренных уставами и наставлениями Советских Вооруженных Сил, на практике оказалось невозможным.
Экономика Афганистана также мало способствовала ведению крупномасштабных интенсивных военных действий на территории страны. Промышленность, находившаяся в стадии становления, была представлена 200–300 предприятиями фабрично-заводского типа, производивших значительно меньше продукции, чем это было необходимо для нормального функционирования страны. Производство электроэнергии колебалось от 0,8 до 1,1 млрд кВт⋅часов, природного газа — от 2,5 до 3 млрд куб. м, угля — от 0,15 до 0,2 млн т, стали — от 0,9 до 1,1 млн т, цемента — от 0,1 до 0,2 млн т.