К операции привлекались 7500 самолетов. Превосходство над противником по всем родам войск и авиации было более чем в 2 раза, а по танкам и артиллерии – в 4 раза.
По прибытии на 1-й Белорусский фронт, после обстоятельного разговора с Г. К. Жуковым, Новиков включился в напряженную работу по подготовке авиаобъединений к операции. Он провел корректировку планов боевых действий 16, 2 и 18-й ВА, а также планов взаимодействия авиации с наземными войсками. Кстати, Александр Александрович уточнил и план действий ВВС Войска польского.
Особое внимание Новиков обратил на организацию действий авиации при прорыве оборонительных полос противника и последующем вводе танковых армий, отдельных танковых и механизированных корпусов, а также при сопровождении их в оперативной глубине. Предусматривалось использовать для сопровождения танковых армий до 70 процентов сил 16-й и 2-й воздушных армий. В первые сутки 18-я воздушная армия должна была нанести массированный удар по опорным пунктам второй оборонительной полосы и ряд таких же ударов в ходе операции.
2-й воздушной армии в первый день операции надлежало нанести четыре массированных удара с целью прорыва обороны и ввода в сражение танковых армий.
16 апреля 1945 года началась Берлинская операция. Как она закончилась, известно всему миру. Отмечу лишь, что советские военно-воздушные силы тогда совершили 92 тысячи боевых самолето-вылетов, уничтожили в воздушных боях и на аэродромах 1232 немецких самолета.
В приказе Верховного главнокомандующего № 359 от 2 мая 1945 года в связи с завершением Берлинской операции отмечены благодарностью и летчики Главного маршала авиации А. А. Новикова.
Летом 1945 года наши войска успешно осуществили стратегическую наступательную операцию по разгрому японской армии на Дальнем Востоке. И здесь Новиков, координируя боевые действия военно-воздушных сил, обеспечил их самое тесное взаимодействие с войсками и флотом на всех операционных направлениях, добился полного господства в воздухе, успешно организовал воздушные десанты по захвату важных стратегических объектов в крупных городах.
За умелое руководство боевыми действиями советской авиации на Дальнем Востоке по разгрому Квантунской армии Президиум Верховного Совета СССР во второй раз присвоил Александру Александровичу Новикову высокое звание Героя Советского Союза.
Тридцатью государственными наградами отмечена полководческая деятельность Главного маршала авиации А. А. Новикова. Его выдающиеся военные заслуги нашли международное признание. Президент США Ф. Рузвельт наградил А. А. Новикова высшим Командорским орденом, президент Франции Ш. де Голль – орденом Почетного легиона высшей степени. В 1946 году А. А. Новиков был избран депутатом Верховного Совета СССР.