В связи с тем, что на Дальнем Востоке Гражданская война все еще продолжалась, Блюхер был направлен в этот регион. Там он занял ключевой пост военного министра буферной Дальневосточной республики, созданной специально для того, чтобы части РККА избежали столкновений с японскими интервентами на Дальнем Востоке. Под руководством Блюхера как главнокомандующего была создана Народно-революционная армия Дальневосточной Республики, освободившая к концу 1922 г. Дальний Восток от белых и интервентов (Блюхер был отозван с Дальнего Востока в июле 1922 г.). Самыми известными сражениями этой армии стали бои под станцией Волочаевка около Хабаровска 10–12 февраля 1922 г. (штурм укрепленной белыми высоты Июнь-Корань) и под Спасском в октябре 1922 г. По просьбе Блюхера на Дальний Восток был командирован его старый соратник с 1918 г. Н. Д. Томин.
«В своем письме, отправленном Вам перед боем под Волочаевкой, я указывал Вам на закулисную дипломатическую работу интервентов, которая идет теперь за Вашей спиной, на ненужность Вашего сопротивления. Теперь боями под Волочаевкой и Казакевичево Народно-революционная армия доказала Вам безумие дальнейшей борьбы против народной воли.
Сделайте из этого честный вывод и покоритесь воле трудового русского народа без дальнейшей упорной игры человеческими головами, которые доверили Вам свою судьбу… Мне хотелось бы знать, какое же количество жертв, какое число русских трупов необходимо еще, чтобы убедить Вас в бесполезности и бесплодности Вашей последней попытки бороться с силою революционного русского народа, на пепле хозяйственной разрухи воздвигающего свою новую государственность? Какое число русских мучеников приказано Вам бросить к подножию японского и другого чужеземного капитала?..
Понятно ли Вам теперь то упорство, с которым бьются под Красным знаменем наши стойкие революционные полки за свою великую новую Красную Русь? Мы победим, ибо мы боремся за прогрессивные начала в истории, за новую в мире государственность, за право русского народа строить свою жизнь так, как подсказывают ему его пробужденные от векового оцепенения силы…
Единственный выход для Вас, и выход Почетный, при теперешнем Вашем положении — это сложить братоубийственное оружие и закончить последнюю вспышку гражданской войны честным солдатским признанием в своем заблуждении и отказом от дальнейшей службы чужеземным штабам»
Из письма белому генералу В. М. Молчанову 23 февраля 1922 г.
С конца Гражданской войны Блюхер, несмотря на отсутствие военного образования и весьма слабое общее образование, вошел в состав военной элиты Советской России. На фронтах мировой и Гражданской войны Блюхер получил восемнадцать ранений.