В шиитской среде, по сути, произошло прямое вооруженное вмешательство соседнего Ирана. Иранский Корпус стражей исламской революции едва ли не открыто действовал на юге Ирака, при, мягко выражаясь, странной пассивности британского командования, контролировавшего четыре южные провинции.
Американцы после победы поддерживали стремления шиитов к политической власти. Так, под их контролем оказалось МВД, тогда как заново создаваемая армия в первое время пополнялась шиитами, и лишь после 2006 года в нее в массовом порядке стали возвращать суннитских офицеров армии Саддама Хусейна.
Однако тут возникло препятствие «природного» характера, заключающееся в склонности самих шиитов не просто к конфликтам, но и к взаимоистреблению. Сам Ирак был наводнен оружием, и на руках гражданского населения были десятки тысяч «стволов», так как весной 2003 года целые бригады, а то и армейские корпуса (как это было в Мосуле) расходились по домам, прихватив с собой оружие. В Ираке сразу же после падения Саддама Хуссейна возникло несколько шиитских группировок, вступивших во взаимную политическую, а потом и вооруженную борьбу.
Первую группировку возглавил аятолла Аль-Систани, иранец по национальности, но сделавший свою карьеру в Ираке при Саддаме Хуссейне и возглавлявший группу шиитских исламских богословов из школ в Наджафе, Самарре, Кербеле. Данная группировка продолжила привычное для нее сотрудничество с властями, в данном случае – оккупационными. Группа установила партнерские отношения с партией «Дава» нынешнего премьер-министра Ирака Нури аль-Малики. Хотя «Дава» и проповедует введение религиозного метода правления, тем не менее, со времен своего нахождения в эмиграции и вооруженной борьбы против Саддама Хуссейна она тесно сотрудничала с США, но в первую очередь с Великобританией и после оккупации Ирака стала проводником как раз британского влияния.
Созданная им партия «Объединенный Альянс Ирака» при поддержке британцев и американского посла в Ираке Залмая Халилзада, победила на выборах в декабре 2005 года. Однако в силу начавшихся трений с курдами и суннитами представитель этой партии, премьер-министр аль-Джаафари, как слишком радикальный элемент, был смещен с поста премьер-министра указом президента Талабани (курда по национальности), и 22 апреля 2006 года Джаляль Талабани назначил Нури аль-Малики премьер-министром Ирака. Вместе с тем Нури аль-Малики сотрудничал с Ираном в ходе своей эмиграции, однако Иран далеко не монолитная среда, что и было показано беспорядками 2009 года.
С Ираном так же тесно сотрудничала и другая шиитская группировка, возглавляемая арабским семейством аль-Хаккима. Глава семейства – Махаммад Бакир аль-Хаким – годами, как и Малики, участвовал в работе Иракского национального конгресса, играя в ней куда более значительную роль, нежели Малики, и имел куда более серьезную поддержку Ирана, где до падения Саддама Хусейна находились его вооруженные формирования – «Бригады Бадра», – вошедшие в Ирак одновременно с наступлением американо-британских войск в 2003 году. Однако Мухаммад Бакир аль-Хаким был убит сразу после своего возвращения в Ирак в мае 2003 года на выходе из мавзолея имама Али в Наджафе в результате взрыва автомобиля- бомбы (тогда погибло 82 человека).