Посмотрим на карачаевскую ветвь Крымшамхаловых, основную княжескую ветвь в регионе. Она образует тесную ветвь с родственными ДНК-линиями, о которых речь пойдет в статье о карачаево-балкарских гаплотипах. Базовый гаплотип этой ветви (суб-клад R1a-Z2123) в 67-маркерном формате (возраст ветви 950±195 лет):
13 25 15 11 11 14 12 12 10 12 11 29–15 9 10 11 11 25 14 20 32 12 14 15 16–11 12 19 23 17 16 17 19 35 38 13 11–11 8 17 17 8 12 10 8 11 10 12 22 22 15 10 12 12 13 8 14 23 21 13 12 11 13 11 11 12 13
Отмечены 8 мутаций от базового гаплотипа R1a-L657, что разводит их общих предков на 8/0.12 = 67 → 72 условных поколения, или примерно 1800 лет, и помещает общего предка ДНК-линий L657 и Z2123 в поле субклада L342.2, как и должно быть (см. дерево субкладов гаплогруппы R1a выше). По сравнению с базовым гаплотипом субклада R1a-L280 предковый гаплотип карачаевских Крымшамхаловых отличается тоже на 8 мутаций, то есть на те же 1800 лет, и помещает общего предка тоже в поле субклада L342.2. Иначе говоря, общий предок перечисленных ветвей L657 и Z2123 был арийский субклад L342.2, от которого пошли и индоарийские (L657) и скифские (Z2124, Z2123) субклады.
Группа сванов и мегрелов из десяти человек имела гаплогруппу R1a. Их базовый 37-маркерный гаплотип имел вид:
13 25 16 11 11 14 12 12 10 13 11 17–16 9 10 11 11 24 14 20 32 12 15 15 16–11 11 19 23 15 16 17 20 34 38 14 11
На таком относительно коротком гаплотипе субклады Z280 и L657 надежно не различить, но ясно, что это гаплотипы общего предка с Русской равнины. Возраст общего предка – 3650±500 лет.
Базовый гаплотип группы M458 на Кавказе имеет вид:
13 25 16 9 11 14 12 12 11 14 11 16 – 16 14 20 12 17 11 23
Он похож на базовый гаплотип центрально-европейской ветви, но с необычной величиной DYS391, видимо, характерной для кавказских гаплотипов. 32 мутации во всей серии помещают его общего предка на 32/10/0.035 = 91 → 100 поколений, или 2500±510 лет до общего предка. Для двух вариантов центрально-европейской ветви этот возраст в Европе составляет 2900±400 лет, что совпадает в пределах погрешности. Между этими двумя базовыми гаплотипами число мутаций равно 5.30 (некоторые мутации дробные), что разводит общих предков M17 и М458 на Кавказе на 5.3/0.035 = 151 → 178 поколений, или 4450 лет. Общий предок обеих субкладов жил примерно (4450+4475+2500)/2 = 5700 лет назад. Это был евразийский субклад Z283, который действительно возник в Европе примерно 5500 лет назад (Rozhanskii and Klyosov, 2012), и центрально-евразийский субклад Z280 – его дочерняя ветвь. Оба они пришли на Кавказ, видимо, во времена арийских миграций.