Как только мир и спокойствие были восстановлены, начались дебаты относительно будущего Малайзии. Был ли Альянс, который победил на выборах, хотя и с меньшим отрывом, чем ранее, той формой коалиции, которой следовало поручить формирование правительства? Результаты выборов 1969 года для МКА были плохими и явно свидетельствовали об утрате поддержки со стороны большинства китайцев. В прессе развернулись ожесточенные дебаты по вопросу о том, был ли смысл в том, чтобы МКА продолжала представлять китайцев в коалиции Альянса? Многие малайцы считали, что МКА подвела Альянс, а потому ей было не место в правительстве. По-видимому, уязвленный этой критикой, лидер МКА Тун Тан Слю Сен (Tun Tan Slew Sen) публично заявил, что его партия не войдет в состав правительства Альянса.
Некоторые малайцы все еще продолжали вынашивать идею формирования чисто малайского правительства на основе коалиции ОМНО, ПМИП и малайских партий, представлявших население Восточной Малайзии. Подобная малайская коалиция располагала бы абсолютным большинством мест в парламенте, состоявшем из 144 депутатов, а также во всех штатах, за исключением Пинанга. Такое правительство могло бы продлить чрезвычайное положение и управлять государством через НОС, который обладал практически неограниченной властью. Было очевидно, что дело шло к расколу Альянса китайских, малайских и индийских партий, обострению расовой конфронтации, а не укреплению сотрудничества между расами. Будущее Малайзии выглядело незавидно: малайцы сосредоточили бы в своих руках абсолютную власть и стали бы пользоваться ею для захвата национального богатства страны.
Следует отметить, что, несмотря на неразбериху и создание новых органов государственного управления и принимаемые ими меры, армия и полиция продолжали профессионально исполнять свои обязанности и выполнять приказы политиков. Тем не менее, власть политиков полностью зависела от военных и полиции, они могли управлять лишь постольку, поскольку «человек с ружьем» выполнял их приказы. В такой ситуации во многих других государствах генералы или офицерский корпус могли бы совершить государственный переворот. Если бы они совершили его в Малайзии в 1969 году, мало кто из политиков остался бы у власти, за исключением, возможно полицейских, которые захотели бы разделить власть с военными. Но в тот момент со стороны военных или полиции не было сделано абсолютно никаких попыток захватить власть и оттеснить политиков в сторону.
Это тем более удивительно, ибо форма правления, введенная для урегулирования сложившейся ситуации, была военной и по сути, и по названию. Национальный оперативный совет в своей деятельности опирался на Военный оперативный совет (military operations council), в котором обычно председательствовал старший по званию военачальник. Поэтому было бы вполне естественно, если бы главнокомандующий вооруженными силами захотел возглавить НОС. Тем не менее, ни генерал Тенку Осман (Tunku Osman), ни генерал Дато Ибрагим Исмаил (Dato Ibrahim Ismail) даже не попытались занять эту должность, хотя они были среди тех, кто внес предложение о создании НОС. Несмотря на ту большую роль, которую играли военные и полиция в восстановлении законности и порядка и выполнении решений НОС, они были вполне удовлетворены тем, что НОС возглавлял гражданский политик — Тун Абдул Разак.