Что касается гомосексуалистов, исследователи выделяют в истории Третьего рейха три периода их преследования. Первый начался в 1933 году с приходом нацистов к власти и связан с борьбой за повышение нравственности, уничтожением широко распространённой в Германии гомосексуальной субкультуры и ведением антигомосексуальной пропаганды. Второй – с ужесточением в 1935 году законов, направленных против геев, и началом их систематического уголовного преследования. Последний начиная с 1940 года характерен усилением репрессий по отношению к геям – членам НСДАП, СС, вермахта и полиции, началом массовой депортации освобождённых из тюрем гомосексуалистов в концлагеря. Отметим, что речь идёт только о мужчинах: дискуссии о привлечении к ответственности лесбиянок велись на высоком уровне, но так и не привели к массовым репрессиям в отношении их.
30 июня 1934 года, когда были арестованы известный своей гомосексуальностью Эрнст Рём и другие высокопоставленные члены СА, Гитлер объявил, что займётся «искоренением этой чумы». Для систематического учёта и контроля гомосексуальных мужчин 10 октября 1936 года секретным указом Гиммлера было основано Имперское центральное бюро по борьбе с гомосексуализмом и абортами, к 1939 году собравшее сведения о 33 тысячах человек.
Точное количество геев, депортированных в концентрационные лагеря, неизвестно. В общей сложности в Третьем рейхе по обвинению в «противоестественном разврате» между мужчинами было осуждено около 50 тысяч человек, из которых 10–15 тысяч было депортировано в концлагеря. Из них около двух третей погибли. Число геев, умерщвлённых по программе эвтаназии в психиатрических лечебницах, казнённых военным трибуналом или отправленных в штрафные батальоны, неизвестно.
Самой известной меткой геев в лагерях была нашивка в виде розового треугольника (для немцев и жителей «протектората»). В отдельных случаях её заменяла жёлтая лента с буквой «А» или числом «175», обозначавшим статью закона, по которой геев осуждали. При этом на оккупированных территориях отношение к геям регулировалось местным законодательством – вплоть до полного отсутствия преследований.
Характерной особенностью ситуации с преследованием геев в Третьем рейхе было полное безразличие к ним в качестве жертв нацизма после войны, включая сохранение в неизменном виде соответствующих статей законодательства вплоть до конца 60-х годов в ФРГ и ГДР. По контрасту с этим начиная с 80-х годов в рамках становления отношения к гомосексуализму как к норме, под давлением американских ЛГБТ-организаций началась раздутая кампания за признание гомосексуалистов такими же жертвами нацизма, как евреи и цыгане. Итогом её стал фантасмагорический рост на Западе, особенно в 2000-х годах, числа «исследований», посвящённых этой теме, преувеличивавших и саму проблему, и число жертв (доходило до утверждений о миллионе убитых фашистами геев).