10 октября 1941 года на совещании нацистского руководства в Пражском Граде, проходившем под председательством имперского протектора Богемии и Моравии Гейдриха, было принято решение сконцентрировать евреев Богемии и Моравии в Терезиенштадте, а «после того как их численность существенно уменьшится, депортировать на Восток». На предварительном этапе осуществления этого плана администрация протектората приказала евреям, жившим в сёлах и маленьких городах, переселиться в гетто.
В ноябре 1941 года первые партии депортированных прибыли в Терезиенштадт. В ноябре – декабре 1941-го около 6 тысяч евреев из Праги и Брно было отправлено в гетто Лодзи и Минска. С 24 ноября 1941 по 6 марта 1945 года в Терезиенштадт было доставлено 73 614 евреев из протектората и несколько тысяч из Судетской области, Словакии, Германии, Австрии, Дании и Нидерландов. Лишь 2803 еврея Богемии и Моравии (большей частью состоявшие в смешанных браках) избежали депортации.
Из Терезиенштадта с 9 января 1942 по 28 октября 1944 года нацисты отправили 60 399 богемских и моравских евреев в Освенцим, Собибор, Майданек, Треблинку, Замосць, Ригу и Минск (выжили 3227 человек). В феврале 1945 года Международному Красному Кресту удалось переправить 1200 узников Терезиенштадта в Швейцарию. К 8 мая, когда город заняли советские войска, в гетто оставались 11 068 человек, из них – менее семи тысяч бывших граждан Чехословакии.
В конечном счёте в годы Катастрофы погибли 75 765 богемских и моравских евреев. Из них 64 172 – в лагерях смерти и восточноевропейских гетто, 6392 – в Терезиенштадте, а 5201 – на территории протектората.
В первые послевоенные годы в Чехословакии, в состав которой вновь вошла вся Словакия, Тешинская Силезия и Судетская область, проживало, по приблизительным оценкам, 50–55 тысяч евреев. Из них – 20–25 тысяч в Богемии и Моравии и 25–30 тысяч – в Словакии. В мае – сентябре 1945 года в Богемию, Моравию и (в меньшей степени) Словакию переселилась значительная часть переживших Катастрофу евреев Закарпатья, которое по советско-чехословацкому договору от 29 июня 1945 года было передано СССР.
Трагичная история уничтожения еврейского населения Польши оккупационными немецкими войсками и их многочисленными союзниками из числа местного населения хорошо известна и подтверждена многочисленными свидетельствами. Значительная часть евреев, заключённых в гетто и рабочие лагеря на территории этой страны, умерла от голода и болезней ещё до отправки в лагеря уничтожения.
Шансы на выживание евреев на польских территориях, присоединённых к Германии, и на землях, вошедших в состав генерал-губернаторства Польши, были одинаково призрачны. В первом случае центральное гетто, созданное в городе Лодзь 30 апреля 1940 года, просуществовало до августа 1944-го. Во втором – стало крупнейшим гетто Варшавы.