В тот период на Туапсе базировалось большое количество боевых кораблей. Нередко туда заходили и из других районов крейсеры, подводные лодки, эсминцы, тральщики, сторожевые катера. Корабли нуждались в постоянном водолазном обслуживании: освобождении гребных винтов от тросов, очистке кингстонов, осмотре рулей и т. п. Из-за отсутствия дока и малых размеров эллинга на судоремонтном заводе отряду приходилось подводить понтоны под оконечности подводных лодок, чтобы иметь доступ к горизонтальным рулям и их ограждениям. Зачастую работы велись в условиях авиационных налетов. Особенно большой опасности подвергались водолазы: во время воздушных тревог их едва успевали поднимать на трапы ботов, а иногда они оставались и под водой.
Боевая деятельность эпроновцев в Севастополе началась с участия в борьбе с минами, которые фашистская авиация систематически ставила на фарватере и внешнем рейде. В первые дни войны на минах подорвались портовый буксир СП-12, один эсминец и буксир с краном. Эсминец получил тяжелые повреждения и загорелся. В ходе спасательных работ его посадили на прибрежную отмель у Константиновского мыса, где и удалось потушить пожар.
Начиная с 22 июня водолазами было найдено и поднято на поверхность воды немало неконтактных мин противника. Это позволило разгадать секрет нового вида оружия гитлеровцев, определить методы его траления и тем самым, в конечном итоге, обеспечить непрерывное плавание по фарватеру и севастопольским бухтам.
Эпроновцы оказали помощь рефрижератору «Кубань», пострадавшему при налете вражеской авиации, спасли плавучий док, оторвавшийся во время шторма от портового буксира и прибитый к берегу.
С ноября 1941 года, когда Севастополь перешел на осадное положение, корабли флота базировались на порты Кавказа. Из спасательных судов в главной базе был оставлен «Меркурий» и несколько водолазных ботов.
Севастопольскую группу до декабря 1941 года возглавляли начальник аварийно-спасательной службы флота С. Я. Шах и военком М. У. Кокидько, а затем — Г. И. Варивода и военком В. Ф. Лунев. Задача заключалась в оказании помощи кораблям и судам, получившим боевые повреждения, судоподъемом группа заниматься, естественно, не могла. Но когда вражеская авиация потопила крейсер «Червона Украина», водолазы вместе с комендорами корабля и артотдела тыла флота в условиях непрерывных авиационных атак противника сняли с корабля, лежащего почти в опрокинутом положении, артиллерийское вооружение и боеприпасы. При выполнении этого нелегкого задания отличились мичман Романовский, главные старшины Заваляев, Коваленко, Лебедь, Антонов, старшина 1 статьи Шевчук, старшины 2 статьи Наумец и Моляр. Руководил работами водолазный специалист Литвинов.