В 1956 г., во время Синайской кампании, подразделения пограничников шли за наступающими войсками.
Иерусалимский полк был переподчинен армейскому командованию и вошел в только что захваченный сектор Газа. На пограничников была возложена задача поддержания порядка. Погранвойска осуществляли зачистки населенных пунктов, патрулирование местности, предотвращали проникновения палестинских террористов на территорию Израиля.
В 1961 г. в Иерусалиме судили нацистского военного преступника Адольфа Эйхмана. Конвойные функции и охрану суда выполняло подразделение пограничных войск. Во время Шестидневной войны 1967 г. части погранвойск сражались в районе Латрунского выступа, пробивая дорогу на Иерусалим.
После войны круг обязанностей погранвойск значительно расширился — были созданы новые базы пограничных войск в освобожденных районах, подразделения пограничников приступили к наведению порядка. В о то время были созданы снайперские группы, появились подразделения по разминированию, подразделения проводников с собаками. В 1972 г. одна из рот пограничных войск была переброшена в Тель-Авив для юрьбы с криминальными элементами. Впервые пограничники начали охранять закон внутри Израиля. В дополнение к прежним задачам, на них была возложена ответственность за охрану воздушных и морских портов, объектов национального значения. На сегодняшний день основной задачей погранвойск является борьба с терроризмом.
Личный состав пограничных войск набирается из полицейских-контрактников и призывников. В 1964 г. оыл принят закон о прохождении срочной службы в рядах пограничных войск, что привело к заметному количественному и качественному росту уровня боевой подготовки пограничников. В настоящее время в рядах пограничных войск проходят службу около 10 тысяч полицейских.
Особое место в МАГАВ занимают спецподразделения по борьбе с террором. По уровню боевой подготовки, опыту проведения антитеррористических операций и оснащенности эти подразделения считаются одними из лучших в мире. Большинство таких подразделений и их операции остаются засекреченными, но иногда информация о них просачивается на страницы средств массовой информации. Среди них наиболее известен спецназ погранвойск ЯМАМ, основным назначением которого является проведение спецопераций внутри Израиля, в частности — освобождение заложников.
ЯМАМ создан в 1974 г. Основной причиной были провалы армейского спецназа при операциях по освобождению заложников, в частности гибель 25 человек, включая 21 ребенка, в ходе операции, проведенной «Сайерет Маткаль» в школе города Маалот 15 мая 1974 года.