При создании СНБУ учитывались и другие важные моменты: общеизвестно, что отсутствие межведомственных барьеров между разведкой и контрразведкой способствует успешному осуществлению комплексных операций в общих интересах защиты государства. Деятельность единого коллектива повышает управляемость, результативность и подконтрольность в работе. Например, при существовании КГБ УССР контрразведка с позиций территории республики в тесном взаимодействии с украинской разведкой добывали значительное число ценной научно-технической информации.
Основное реформирование осуществлялось следующим образом. На базе разведывательных подразделений КГБ создавалось Главное управление национальной разведки с включением в его состав СНБУ. Самостоятельность разведки обеспечивалась впервые внедряемым в практику правовым механизмом: руководитель украинской разведки назначался на должность с согласия Верховного совета Украины наряду с главой СНБУ. Его административная независимость дополнялась финансированием деятельности разведки отдельной строкой в бюджете, широкими полномочиями по определению оперативно-служебных и функциональных задач разведки, самостоятельному назначению и перемещению кадров и т. д.
Перед сотрудниками Главного управления национальной разведки ставились задачи добывать разведывательную информацию политического, военно-стратегического, научно-технического, экономического характера, которая имела жизненно важное значение для успешного решения международных и внутренних проблем в интересах Украины.
Главному управлению контрразведки в качестве основных задач определялось получение сведений о планах вражеских спецслужб, выявление и пресечение шпионажа и иных разведывательно-подрывных посягательств против суверенитета и территориальной целостности Украины.
Экономическая контрразведка наделялась правами ведения оперативной работы в сфере народно-хозяйственного комплекса, атомной энергетики, оборонных предприятий, транспорта и иных важных объектов жизнеобеспечения, а также предупреждения аварий, взрывов и иных чрезвычайных происшествий в отраслях промышленности. Предусматривалась защита государственной тайны и секретных сведений.
В рамках контрразведывательной деятельности особо значимым являлось направление борьбы с терроризмом, защиты национальной государственности и конституционного строя от преступных посягательств как внутри страны, так и извне.
Управление военной контрразведки, по нашему замыслу, должно направлять оперативную деятельность на защиту вооруженных сил Украины, других воинских формирований от подрывных акций спецслужб зарубежных государств. Способствование командованию в повышении боеготовности войск, сохранении военных секретов — эти функции также предписывались будущим сотрудникам военной контрразведки.