Собрав все необходимые документы и свидетельства, указанная комиссия составила общий список обвиняемых, разделив их на несколько групп:
– чиновники, состоявшие на государственной службе или находившиеся в отставке;
– купцы;
– иностранцы, принявшие присягу на русское подданство;
– иностранцы, не принимавшие присягу;
– в отдельную группу были выделены три человека – дворовый Е. Ушаков, вольноотпущенный И. Ермолаев и воспитанник военно-сиротского отделения Н. Репников.
Естественно, что вина чиновников или иностранцев, принявших присягу, считалась значительно большей, чем купцов или иностранных подданных. В общий список подследственных были включены фамилии 69 человек. Позже к ним добавили имена помощников Находкина – Бестужева-Рюмина и Коробова.
Среди содержавшихся во временной тюрьме было также трое помещиков Смоленской губернии, занимавших полицейские должности при оккупации Смоленска и не подлежавших ведению Московской комиссии. В связи с тем, что они не имели знакомых в Москве, за них долго никто не мог поручиться, и они оставались под арестом до начала 1814 года.
16 февраля 1813 г. Комиссия представила оконченное следствие министру юстиции Д. Трощинскому, который направил его в Сенат. Сенат затребовал по некоторым подсудимым дополнительные сведения, в частности формулярные списки тех чиновников, которые ранее не смогли это сделать. Это задержало окончательное решение, которое было принято только в 1814 года.
В конце концов Сенат разделил всех обвиняемых на пять групп в зависимости от степени вины. Максимальное наказание получили 22 подсудимых, вошедших в состав первой группы – большая часть ее (17 человек) состояла из иностранцев. Подсудимые этой группы характеризовались как люди «сомнительной нравственности и правил, противных святости присяги верноподданного и доброго гражданина». 10 человек иностранных подданных были приговорены к высылке за границу, русские подданные иностранного происхождения (Виллерс, Паланж, Реми, Бушот, Дюлон, Прево) – к ссылке в Сибирь на поселение с лишением доброго имени, дворянства и чинов (если таковые имелись); чиновникам Бестужеву-Рюмину и Щербачеву запрещалось вновь вступать на службу. Купца Смирнова приговорили к наказанию плетьми и отдаче в рабочие, а Капустина и Татарникова – к содержанию под арестом в течение месяца.
Во вторую группу было включено 37 человек, которые обвинялись:
– в подписании журналов заседаний московского муниципалитета;
– в закупке продовольствия для французских войск;
– в исполнении обязанностей переводчиков.
Сенат признал, что хотя они «приняли на себя от неприятеля должности, но в том, что добровольно, а не из-за неприятельских угроз, не изобличены». Среди них был и бывший городской голова Москвы Находкин.