Москва присягнула 16-летнему сыну Бориса, Феодору Годунову. Было отправлено под Кромы особое посольство для приведения осаждавшего этот город войска к присяге новому государю. Войско тоже присягнуло. Но скоро в нем обнаружилась измена. Князья Василий и Иван Голицыны, Михаил Салтыков, Петр Басманов, братья Ляпуновы и другие главные военачальники перешли на сторону самозванца. Увлеченные ими полки тоже нарушили присягу, данную новому царю, и перешли к Лжедимитрию.
С этими новыми подкреплениями самозванец двинулся из Путивля к Москве. Всюду по пути его встречали как законного государя. 1 июня в Москву явились от него Плещеев и Пушкин, собрали народ и читали ему грамоту, в которой рассказывалась вся история царевича — его спасение от смерти, его пребывание в Польше и поход в столицу. Народ не знал, чему верить, и вызвал на Красную площадь Василия Шуйского, который вел следственное дело об убийстве Димитрия. Шуйский явился и уверил всех, что Борис действительно посылал в Углич людей убить Димитрия, но последний спасся, а убит был поповский сын. Услышав это, толпа бросилась с Красной площади в Кремль, схватила царя Феодора вместе со всеми его родственниками и перевела их в старый боярский дом Годуновых. Через десять дней от самозванца приехали в Москву князья Голицыны и Мосальский с тем, чтобы «покончить» с Годуновыми. Они задушили царя Феодора, его мать и Семена Годунова, а остальных родственников Бориса отправили в изгнание.
20 июня 1605 года Лжедимитрий торжественно вступил в Москву. Прежде всего он поехал в Архангельский собор, где был похоронен Иоанн Грозный, и горько плакал над его гробницей. Через несколько дней после этого он вернул из ссылки своих мнимых родственников, попавших в опалу при Годунове, — Нагих и Романовых, щедро осыпав их милостями. В конце июля приехала в Москву царица Мария Федоровна Нагая, мнимая мать самозванца. Произошла трогательная встреча. Лжедимитрий держал себя с ней как нежный сын, а царица встретила его как любящая мать. Самозванец, по-видимому, искренно считал ее своей родительницей.
Московское население сначала было в восторге от нового царя. Но вскоре отношения между Лжедимитрием и народом стали ухудшаться. Русские люди с удивлением замечали, что царь совсем не похож на прежних царей: не посещает храмов, не спит после обеда, запросто бродит по Москве, одевается по-польски, водится исключительно с поляками, пляшет на придворных вечерах и маскарадах, нарушает посты, не кладет поклонов и т. д. Бояре были обижены тем, что царь предпочитает им иноземцев, называет их невеждами и т. п. Народное недовольство вызывали больше всего окружавшие царя поляки. Они держали себя в Москве, как в завоеванном городе, и оскорбляли на каждом шагу щепетильное национальное чувство московских жителей: входили в церковь в шапках, нередко с собаками, громко болтали там, смеялись. Русским женщинам небезопасно было показываться на улицах города. Высшее русское духовенство тоже было недовольно равнодушием царя к православной церкви. Кроме того, оно упорно не соглашалось на брак царя с католичкой Мариной Мнишек. Лишь с большим трудом патриарху Игнатию удалось уговорить архиереев согласиться на присоединение Марины Мнишек к православной церкви не через крещение, а только через миропомазание и причащение по православному обряду.