В трудных условиях приходилось работать Главному и Политическому управлениям пограничных войск. Факты свидетельствуют, что не все удалось им сделать по подготовке войск, особенно к действиям в боевых условиях. Не решена была и такая задача, как боевое сколачивание пограничных отрядов, что наглядно показали первые бои на государственной границе, когда большинство отрядов как единая войсковая часть не действовали. И одной из причин этого была плохая укомплектованность и большое движение личного состава. Так, некомплект по подразделениям границы в 90-м погранотряде Украинского погранокруга на 1 января 1941 года составлял 22,15 %. Было откомандировано для службы в оперативные войска 164, передано на формирование новых погранчастей в Белорусском округе 280, командирован на пополнение школ сержантского состава 71, откомандировано в 97-й погранотряд 20 человек. В то же время отряд получил из других округов 220, и было возвращено из расформированных частей оперативных войск НКВД 472 человека. Такое положение со штатной укомплектованностью и движением личного состава было и во всех других сорока девяти пограничных отрядах западной границы.
Нельзя считать правильным, что за период с 1 января по 22 июня 1941 года была сокращена правительственная численность пограничных войск с 195 520 человек до 168 135 человек за счет исключения из состава ГУПВ Управления оперативных войск с правительственной численностью 27 385 человек. Была за это время сокращена и штатная численность погранвойск с 192 354 человек до 162 178 человек. Сократился и списочный состав погранвойск. Если на начало 1941 года в них было 178 784 человека, то к началу военных действий оказалось только 158 015 человек[35]. Около 90 тысяч из них было сосредоточено в восьми западных пограничных округах, а именно: Мурманского (начальник войск — генерал-майор К. Р. Синилов, начальник ОПП — бригадный комиссар М. И. Хуртин, начальник штаба майор А. Л. Прусский), Карело-Финского (начальник войск — генерал-майор В. Н. Долматов, начальник ОПП — полковой комиссар Н. П. Шпаков, начальник штаба полковник Н. С. Киселев), Ленинградского (начальник войск — генерал-лейтенант Г. А. Степанов, начальник ОПП — полковой комиссар С. И. Гусаров, начальник штаба — полковник К. А. Антонов), Прибалтийского (начальник войск — генерал-майор К. И. Ракутин, начальник ОПП — бригадный комиссар Н. Н. Потехин, начальник штаба — полковник И. М. Иванов), Белорусского (начальник войск — генерал-лейтенант И. А. Богданов, начальник ОПП — бригадный комиссар Ф. А. Верещагин, начальник штаба — полковник С. А. Сухарев), Украинского (начальник войск — генерал-майор В. А. Хоменко, начальник ОПП — бригадный комиссар Я. Е. Масловский, начальник штаба — полковник В. Т. Рогатин), Молдавского (начальник войск — генерал-майор Н. П. Никольский, начальник ОПП — бригадный комиссар Н. А. Клюев, начальник штаба полковник Н. П. Великанов), Черноморского (начальник войск — генерал-майор А. Я. Киселев, начальник ОПП — полковой комиссар Г. В. Колпаков, начальник штаба полковник Н. Э. Тимашков).