Как член Петроградского Военно-революционного комитета Менжинский принимает непосредственное участие в подготовке и проведении Октябрьского вооруженного восстания. Когда ЦК партии по предложению В. И. Ленина принял резолюцию о вооруженном восстании как практической задаче дня, часть членов Бюро Военной организации высказалась «за небольшую отсрочку». Лишь Менжинский и Мехоношин решительно поддержали ленинскую резолюцию и «высказались за немедленное выступление».
Как комиссар ВРК Менжинский принимает участие в штурме Зимнего дворца и в работе II съезда Советов.
«В. И. Ленин ценил Менжинского, — говорится в биографии Вячеслава Рудольфовича, хранящейся в Центральном партийном архиве Института марксизма-ленинизма, — за его страстную революционную натуру бойца, и не случайно его выбор пал на Менжинского, когда в первые дни Октябрьской победы нужно было взять в руки пролетариата важнейшую цитадель капиталистического строя — Государственный банк».
В. Р. Менжинский, народный комиссар финансов в первом Советском правительстве, блестяще выполнил эту задачу. В революционное время он действовал по-революционному, решительно преодолевая сопротивление классового врага. О его деятельности в исторические дни слома старого буржуазного государства и утверждения новой, народной власти рассказывают в своих воспоминаниях активные участники Октябрьской социалистической революции В. И. Невский, А. Ф. Ильин-Женевский, Г. И. Ломов, С. С. Пестковский, В. Р. Менжинская и другие. О его работе в Народном комиссариате финансов, в ВЧК и Комиссариате юстиции пишут старые большевики А. М. Гиндин, Н. Н. Крестинский, Е. М. Соловей. Они характеризуют Менжинского как зрелого и дальновидного государственного деятеля.
Широкий политический кругозор, глубокий и гибкий ум, образованность, личное обаяние, знание европейских языков послужили основанием для назначения Менжинского генеральным консулом РСФСР в Берлине. С присущими ему энергией и выдержкой Вячеслав Рудольфович стойко защищает интересы молодой Советской республики.
По требованию имперского правительства, разорвавшего дипломатические отношения Германии с Советской Россией, наши дипломаты и в их числе Менжинский в ноябре 1918 года были вынуждены покинуть Берлин. Вернувшись в Москву, Вячеслав Рудольфович выполняет ряд поручений Центрального Комитета партии: участвует в переговорах с немцами на Западном и Центральном фронтах об отводе германских войск с оккупированных территорий Белоруссии и Украины, затем — в переговорах с украинской Директорией. С победой Советской власти на Украине назначается заместителем народного комиссара социалистической и военной инспекции Украинского советского правительства. По решению Политбюро ЦК КП(б)У вводится в состав ВУЧК. Командированный правительством Советской Украины в прифронтовую полосу с чрезвычайными полномочиями, он организует борьбу с кулацкой контрреволюцией, агентурой Деникина и шпионами империалистических государств.