И, несмотря на это, осенью 1907 года совершилось третье восстание во Владивостоке. В апреле 1907 года была организована владивостокская группа РСДРП. Она боялась устраивать новое восстание, так как считала, что оно обречено на поражение и лишь приведет к очередной волне преследований революционеров. Эсеры все же призвали солдат и матросов к новому восстанию. Одним из поводов к нему явился приговор к смертной казни группы солдат-минеров, расправы над другими революционерами. Утром 16 октября в районе бухты Диомид минеры подняли восстание, в военном порту за ними последовали рабочие и матросы. Эти выступления были подавлены, но утром 17 октября повстанцами были захвачены миноносцы «Скорый», «Сердитый», «Бодрый» и «Тревожный». «Сердитый» и «Тревожный» вскоре были освобождены от повстанцев, а миноносец «Скорый» открыл огонь по дому губернатора и другим административным зданиям. В результате погибла одна женщина. Затем «Скорый» обстреляли правительственные миноносцы, и он был освобожден. Правительственные войска, обладая перевесом сил, опять подавили восстание; все рабочие военного порта были уволены, участников восстания судил Приамурский военно-окружной суд с 12 ноября 1907 года до 13 марта 1908 года. 46 участников восстаний были приговорены к расстрелу, остальные отправлены на каторгу или в дисциплинарные батальоны, военные тюрьмы.
Особое мнение авторов. В советских источниках вооруженные восстания во Владивостоке считались яркой, славной и героической страницей революционного движения. Некоторые же сегодняшние авторы называют те события политическим бандитизмом группы провокаторов из военно-партийной организации РСДРП и эсеров. Мы же здесь хотим подчеркнуть лишь то, что все было менее революционно, гораздо прозаически, чем пытались и пытаются подавать отдельные политики и исследователи. На самом деле осенью 1905 года восставшие организовали во Владивостоке большие погромы и поджоги. 30—31 октября весь город был страшно разгромлен толпами хулиганов. Материальные потери города могли быть выражены цифрой 8—10 миллионов рублей. Сколько во время погрома было человеческих жертв – неизвестно. Началась эта «революция» во Владивостоке с большой попойки, которую устроили моряки и солдаты квантунских батальонов, прибывших в город после окончания боевых действий в Маньчжурии для отправки по домам и получивших на руки в одночасье по глупости начальства все полагающиеся им «фронтовые». Досада за проигранную японцам войну, дурость армейского начальства и антигосударственная агитация социал-демократов и эсеров «вскипятили разум возмущенный». К пьяной матросской и солдатской массе (а это более 2 тыс. человек), под шумок, чувствуя момент, присоединились местные уголовники и люмпены. Во Владивостоке начались погромы, грабежи, убийства и поджоги. В итоге в историческом центре города было уничтожено огнем более 40 % различных зданий. Среди них магазин «Кунст и Альберс», театр «Золотой Рог», Матросская слободка, военно-окружной суд, морская библиотека, где находилось 40 тыс. уникальных, редких книг и т.д.