22.09. 1941 г. на немецкой мине у Новороссийска подорвался транспорт «Крым», транспорт удалось отбуксировать, но он вышел из строя до конца войны. И опять ситуация та же. Падение немецкой мины было засечено постом СНИС, но пароходство своевременно не было оповещено. Военный лоцман получил 8 лет лагерей, с отсрочкой исполнения до конца войны.
В сентябре 1941 г. флот понес еще одну потерю, никак не связанную ни с десантом, ни с боевыми действиями вообще. Севастопольские кораблестроители в сентябре – октябре 1941 г. совершили трудовой подвиг, завершив ремонт почти всех кораблей и подводных лодок, находившихся в заводе. Одновременно шла достройка новых кораблей, переведенных из Николаева. 30 сентября 1941 г. новенький эсминец «Совершенный» вышел из Севастополя на ходовые испытания. В этот день планировалось подписание приемного акта.
Корабль вышел на мерную милю в районе Херсонесского маяка для проведения испытаний на полном ходу. Эсминец легко развил скорость в 36 узлов, все механизмы работали исправно, но в 16.42 корабль наскочил на мину советского же минного заграждения. Корабль из-за ошибки штурмана отклонился с фарватера. В месте взрыва верхнюю палубу вспучило на полметра, котельный кожух первой трубы разорвало с обоих бортов. Все оборудование 1-го машинного и 2-го котельного отделений было уничтожено: котел № 2 сорвало с фундамента, а турбину низкого давления первого турбозубчатого агрегата приподняло вместе с фундаментом и загнуло влево. Разрушило и пост энергетики и живучести. Во 2-м котельном отделении вспыхнул пожар, мазут горел в течение двух часов.
Около 17.00 к аварийному эсминцу подошел минный заградитель «Дооб» (мобилизованное судно, типа «Заря»), а чуть позже, около 18.30 – спасательные суда «Шахтер» и «Меркурий». Ночью аварийный корабль был посажен на мель в Казачьей бухте. Утром 1 октября буксир СП-14 отбуксировал корабль в док. В строй этот корабль так и не вошел: 12 ноября он был потоплен в доке. В феврале 1942 г. док осушили, эсминец попытались восстановить, но он был повторно потоплен немецкой авиацией и артиллерией 15 июня 1942 г. Досадно признавать, что новейший, еще не вступивший в строй боевой корабль был потерян из-за своей же навигационной ошибки.
В этот же день к югу от Керченского пролива был потоплен большой недостроенный теплоход «Пугачев». Он следовал на буксире у рефрижераторного судна «Кубань» из Керчи в Новороссийск с грузом зерна и был потоплен вражеской авиацией. Проводку должна была организовать Новороссийская военная база, но по неизвестной причине конвой следовал без охранения (опять просчет Новороссийской базы).