Оборона противника перед войсками 6-й гвардейской танковой армии была подготовлена не везде одинаково. В основном она состояла из двух оборонительных полос. В полосе наступления 7-й гвардейской армии 2-го Украинского фронта, где вводилась в прорыв 6-я гвардейская танковая армия, оборона немцев состояла из оборонительных сооружений полевого типа, созданных в тактической глубине. Долговременные укрепления на границе Чехословакии и Австрии на этом направлении были преодолены еще в ходе предшествующей операции.
Общее соотношение сил и средств к началу мая 1945 года было в пользу советских войск.
Развивая наступление, 6-я гвардейская танковая армия должна была нацеливать свои усилия на быстрый выход к Праге, решительно отрываясь от остальных сил фронта. Это позволило в последующем превысить запланированный темп наступления в два раза. Развитию высоких темпов наступления способствовало и то, что противник с самого начала был деморализован и не мог оказать организованного сопротивления даже на выгодных для обороны рубежах.
6 мая 1945 года командующий 6-й гвардейской танковой армией генерал-полковник танковых войск А. Г. Кравченко поставил войскам боевые задачи. Согласно его приказу, с вводом в прорыв главный удар наносился правым флангом армии, силами 5-го гвардейского танкового корпуса в направлении Моравски-Крумлов, Яромержице. Оперативное построение армии было в два эшелона. Первый эшелон составляли 5-й гвардейский танковый корпус и 9-й гвардейский механизированный корпус. Второй – 2-й гвардейский механизированный корпус, который должен был продвигаться за 9-м гвардейским механизированным корпусом в готовности обеспечить левый фланг армии и развить успех корпуса. 2-й гвардейский механизированный корпус к началу операции имел на ходу 37 танков. В армейский резерв выделялся 4-й гвардейский мотоциклетный полк и 275-й батальон особого назначения, имевший 99 машин «амфибия».
Боевые задачи войскам были поставлены только на первый день наступления с указанием направлений дальнейших действий с утра второго дня операции. Войска армии должны были быть готовы и к ночным действиям. От корпусов первого эшелона выделялись передовые отряды, каждый в составе усиленной бригады, для захвата переправ на р. Рокитна.
Совместно с фронтовой артиллерией артиллерия 6-й гвардейской танковой армии привлекалась к участию в артиллерийской подготовке. В последующем артиллерия армии должна была обеспечивать ввод своей армии в прорыв и ее действия при развитии наступления на Прагу.
Для авиационной поддержки наступления войск 6-й гвардейской танковой армии на всю глубину операции выделялся штурмовой авиационный корпус 5-й воздушной армии. Прикрытие боевых порядков войск армии с воздуха возлагалось на истребительный авиационный корпус.