Но правительство уже получало тревожные сигналы, тоже готовилось. А теперь отреагировало сразу же. На Украину двинулось королевское войско. Оно обрастало шляхтой, отрядами магнатов. Сейчас-то они не медлили, съезжались дружно – защищать собственные имения. Командование армией приняли коронный гетман Станислав Конецпольский и польный гетман Потоцкий. Удалось удержать в повиновении и часть реестровых. Вместо казненного Кононовича гетманом над ними поляки поставили Ильяша Караимовича по прозвищу Армянчик. Хотя он был не армянином, а то ли крещеным евреем, то ли караимом.
Большинство крестьянских повстанцев не уходило далеко от родных сел – ограничивались тем, что разоряли усадьбы «своих» панов и занимали соседние местечки. Конецпольский и Потоцкий решили поначалу не отвлекаться на них, истребляли только тех, кто попался по пути. Сочли, что первым делом надо выкорчевать корень мятежа, уничтожить казачье ядро Павлюка и Томиленко. Повели армию прямо на них. Столкновение произошло под Кумейками возле Чигирина. Запорожцев атаковала наемная пехота, шляхетская конница. Они отбивались, огородились таборами из телег, окапывались. Но их окружили, положение стало тяжелым.
Тем не менее они трижды прорывали кольцо. Тремя партиями сумели выйти. Стали отступать. Возле местечка Боровица под Черкассами поляки догнали их и вновь окружили. Осадили по всем правилам военного искусства. Оцепили казачьи окопы своими. Отрезали казаков от воды. Повстанцы изнемогали, среди них начались разлад, свары, взаимные обвинения. Паны воспользовались, предложили переговоры. Обещали прощение и милости, если принесут повинную. Старшина и многие казаки настояли, чтобы Павлюк согласился обсудить с Конецпольским эти условия, а поляки гарантировали ему и сопровождающим полную безопасность. Но когда Павлюк, Томиленко и Лихой явились на переговоры, их схватили. А казакам объявили, что они должны подписать новый договор, дать клятву повиноваться королю, и их отпустят.
Повстанцы разделились. Одни не верили врагам, указывали, что они уже нарушили слово. Ринулись прорываться. Другие вспоминали, что 12 лет назад, во время восстания Жмайла, казаков помиловали именно таким образом, когда они заключили Кураковский договор и принесли присягу. Послушались, прекратили сопротивление. Но как только они сложили оружие, поляки на них набросились, многих перебили, остальные разбегались кто куда. Павлюка, Томиленко и Лихого отвезли в Варшаву, подвергли зверской казни. А польская армия занялась зачистками мятежных районов. Украину было решено наказать самым свирепым террором, чтобы навсегда отбить мысли о бунтах. Карательные отряды прочесывали страну. Восставшие села сжигали, жителей казнили поголовно. Если село осталось мирным, но кто-то из крестьян ушел к повстанцам, казнили их семьи и сжигали хаты.