Нечто подобное разграничению на реестровых и запорожских казаков существовало и в пиратской среде. К концу XVII века Англия и Франция начали самостоятельные колониальные захваты. В таких условиях пираты уже становились не помощниками, а противниками. Теперь флибустьерам необходимо было выбирать между каперством (пиратством под флагом и покровительством своего правительства во время войны) и вольным независимым пиратством, которое сулило суровое наказание. Те же пираты, которые до этого момента разбогатели, становились купцами и покупали дворянские титулы. Таким образом, многие представители палаты лордов в Англии стали выходцами из пиратов, например, Ф. Дрейк, Г. Морган и др.
В этом есть много схожего в процессах, которые происходили на степном пограничье России. Московское царство становилось все сильнее и расширяло свои границы, образуя Российскую империю. В таких условиях казачьи сообщества, ранее служившие щитом России со стороны степей, должны были измениться и перейти на государственную службу, что представляет сравнительную параллель с каперством. Непокорные же должны были исчезнуть, как и вольные пираты. Прослеженная же нами судьба казачьей элиты Украины, которая приобщилась к дворянству, очень похожа на судьбу английских пиратов, ставших дворянами.
Запорожская Сечь оставалась от этого в стороне. Обладая широчайшей автономией, она сохраняла прежнюю структуру управления и представляла собой квази-государственное образование, зависимое от Российской империи. Но такое положение дел уже не могло устраивать Россию. Основными причинами для этого стали: исчезновение крымской угрозы; освобождение от опасности набегов на плодородные земели и возможность их использования со стороны государства; наличие внутри государства потенциально опасной организованной силы – Запорожской Сечи, в которой к тому моменту уже были утрачены признаки рыцарского ордена.
В Сечь стала стекаться голутва с ориентацией на разбой (гайдамацтво), в ней увеличивалось имущественное расслоение. Пугачевский бунт подтолкнул российское правительство к принятию необходимых мер по предотвращению подобного на Запорожье.
Во второй половине XVIII века (период Новой Сечи), запорожская старшина стала обладать крупными земельными владениями, стадами, зимовниками и промыслами. Формально это принадлежало всему Запорожскому войску, но рядовые казаки ничего не получали. Поэтому российское правительство гарантировало запорожским старшинам неприкосновенность их собственности и приступило к ликвидации Запорожской Сечи. В 1775 году Сечь перестала существовать юридически, а сама ликвидация прошла практически мирно.