Большинство потерь афганцы несли при посадках на горных аэродромах, сложных и для опытных пилотов.
Помимо потерь от ПВО моджахедов, афганцы лишились нескольких самолетов, уничтоженных пакистанскими истребителями F-16. При вылетах в приграничные районы 17 мая 1986 года была сбита пара Су-22М, следующий самолет этого тина был потерян 16 апреля 1987 года и еще один —3 ноября 1988, причем летчик последнего капитан Хашим попал в плен к пакистанцам.
Вместе с тем среди афганцев встречались и классные пилоты, к числу которых принадлежал и генерал-лейтенант Мустафа, к 1991 году — заместитель Главкома ВВС и ПВО. Этого летчика дважды сбивали, он перенес ряд сложных операций, по вернулся в строй и продолжал летать много и охотно. По прихоти судьбы он стал и виновником инцидента 4 июля 1991 года: вылетев на бомбардировку лагеря моджахедов, летчик потерял ориентировку в однообразной местности на севере Афганистана, пересек границу и атаковал поселок Намапгути-Поен в Таджикистане, сбросив 4 бомбы по 250 кг.
К осени 1987 года афганцы получили Су-22М4. К этому времени Су-22М уже был снят с произведет ва и требование унификации по двигателю отпало само собой перед валом просьб Кабула о поставках все новой и новой военной техники.
С уходом советских войск афганские Су-22 продолжили боевую работу, однако безнадежная война привела к тому, что им пришлось бомбить не только душманские базы, кишлаки и горные тропы. Во время попытки государственного переворота, предпринятой в марте 1990 года министром обороны Танаем, поддержавшие мятеж летчики из Баграма наносили удары по Кабулу, выполнив 18 самолето-вылетов и сбросив 42 бомбы. Ответными артиллерийскими и авиационными налетами на базе были выведены из строя 46 самолетов, правда, 34 из них позже удалось вернуть в строй.
Неразбериха продолжалась и в дальнейшем: периоды активности, когда для поддержки операций правительственных войск под Хостом и Джелалабадом летчики выполняли по 100-120 вылетов ежедневно, сменялись упадком, участились случаи дезертирства и перелетов в Пакистан. Падение Кабула не поставило крест на афганской авиации. Привилегированное положение летчиков и известное уважение к ним даже со стороны новых исламистских властей привели к тому, что Су-22М продолжали летать на боевые заданий теперь уже по новым целям и против новых противников. Неприхотливые и надежные самолеты оставались в строю: так 30 января и 28 февраля 1994 года три, а 25 апреля 1995 года один Су-22М были сбиты в ходе продолжающихся стычек.
Афганский Су-22М4 возвращается из боевого вылета. Декабрь 1988 года.