Сохранился отчет о работе Спецотдела за 1921 год. В нем, в частности, было указано, что с самого начала успешно проводилась разработка и изготовление новых кодов и шифров. Только за этот год было введено в действие на различных линиях связи 96 новых кодов. Эта работа сотрудников Спецотдела активно поддерживалась правительством. Характерной для того времени была телеграмма секретаря ЦИК СССР А. С. Енукидзе Г. И. Бокию, хотя и относилась она уже ко 2 сентября 1924 года и была связана с окончанием работы над телеграфным кодом:
«Поздравляю тов. Г. И. Бокия с окончанием составления „Русского кода“ — этого громадного и сложного труда.
„Бытие определяет сознание“. Бытие и необходимость современных сношений, быстрая связь и экономия во времени толкнули людей к созданию этого нового языка „кода“, языка, не похожего ни на один человеческий язык.
Как маленький кусочек радия при разложении испускает колоссальное количество энергии, так и слова „кода“ — короткие, непонятные и неудобопроизносимые для нашего языка, при расшифровке развертывают перед нами ряд фраз и мыслей, посылаемых или получаемых нами издалека.
Как стенография стала необходимой для точной записи и размножения человеческой речи, так и язык „код“ становится и должен стать необходимым в сношениях между людьми, находящимися на разных точках земного шара.
Я уверен, что „код“ получит широкое применение во всех наших учреждениях Союза ССР.
Раз темп работы Октябрьской революции нас привел к тому, что мы вынуждены были красивый и гибкий русский язык произносить с сокращением слогов, то по проводам и воздушным волнам мы смело будем сноситься концентрированным языком „код“, тем более что он будет доходить до адресатов в красивом, развернутом и понятном виде.
Я со своей стороны призываю все учреждения ввести у себя при сношениях по телеграфу и радио язык „код“. А. Енукидзе».
В начале 1920-х годов Спецотдел включал шесть, а позже — семь отделений. Однако собственно криптографические задачи решали только три из них: второе, третье и четвертое. Так, сотрудники второго отделения занимались теоретической разработкой вопросов криптографии, созданием шифров и кодов для ВЧК и всех других учреждений страны (включая НКИД, Военное ведомство и т. д.). Отделение в первые годы работы состояло из семи человек, а его начальником был Федор Григорьевич Тихомиров.
Перед третьим отделением стояла задача ведения шифроработы и руководства этой работой в ВЧК. Состояло оно сначала всего из трех человек, руководил отделением старый большевик, бывший латышский стрелок Федор Иванович Эйхманс (1897–1938), который одновременно был заместителем начальника Спецотдела. Ф. И. Эйхманс организовывал шифросвязь с зарубежными представительствами СССР, направлял и координировал их работу.