Ельцин по подсказке Березовского пытался тогда организовать еще одну чудовищную провокацию. Ситуация особенно обострилась накануне и в день денонсации Государственной думой беловежских документов. А как должны были поступать депутаты? При подписании этих документов российский президент и компания нарушили не только Конституцию СССР, но десятки статей действовавшей в то время Конституции РСФСР.
Они хотели ввести войска в Москву и занять Госдуму. В Думе и вокруг здания уже находился ОМОН. Мне позвонили военные, с которыми я был хорошо знаком, и сказали: «Делайте что хотите, но это будет на порядок хуже 93-го года». Ельцин подготовил три указа: о разгоне Думы, о запрете компартии и об интернировании почти 400 политиков. Но мы приняли тогда очень серьезные и решительные меры, сумели повлиять на общественное мнение. И они не решились. Президент вынужден был порвать проекты своих указов и отменить уже принятое решение.
Многие российские политики испытывали давление со стороны Березовского. К концу 1990-х годов, после обеспечения президентской кампании Ельцина на выборах 1996 года, Березовский превратился в самого влиятельного олигарха. Ельцин не только «отблагодарил» Березовского в коммерческом смысле, позволив укрепить его бизнес-империю. Березовский занимает высокие должности в структурах государственной власти: заместитель секретаря Совета безопасности, исполнительный секретарь СНГ, а затем стал депутатом Государственной думы от Карачаево-Черкесии. Видимо, в то время его уже перестает удовлетворять роль лоббиста, пусть и на самом верху государственной власти. Теперь он лелеет мечту, стремится приватизировать саму государственную власть в России. Пожалуй, это время имел в виду директор ЧОП «Атолл» (охрана олигарха) Сергей Соколов, когда сказал: «Березовский был стратег семьи Ельцина, Бадри Патаркацишвили — бухгалтер, а Абрамович — ключник, кассир».
Будучи заместителем секретаря Совета безопасности, Березовский теперь приезжает на Северный Кавказ как представитель федерального центра. Он безграмотно вмешивается в дела российских военных, идет на весьма странные контакты с чеченскими боевиками. Генерал-полковник, Герой России Геннадий Трошев в своих воспоминаниях «Моя война. Чеченский дневник окопного генерала», сославшись на А. Кадырова, писал, что накануне вторжения в Дагестан Березовский «спонсировал» Шамилю Басаеву один миллион долларов.
Трошев командовал в 1995–2002 годах федеральными войсками в Чечне, а затем в Дагестане и был достаточно информирован. Он выразил большое сомнение в истинных мотивах освобождения Березовским из плена российских солдат, их отпускали уже через 1–3 дня после пленения, чего почти никогда раньше не бывало. Причем среди освобожденных почти все были только рядовыми. Генерал отметил, что действия похитителей и освободителей выглядели на редкость скоординированными, более того, штаб СКВО располагал доказательствами сговора с бандитами. Он так подытожил свои рассуждения на эту тему: «Быстрое освобождение нескольких групп российских солдат поставило больше вопросов, нежели дало ответов. И как-то в тени на этом фоне осталось очередное высказывание тогдашнего министра по делам национальностей Рамазана Абдулатипова, который заявил, что в расцвете торговли людьми на Северном Кавказе во многом виноваты те, кто пытается показать, сколь велико их влияние в Чечне. Это был явный намек на Бориса Березовского».