Королю доложили, что его аудиенции добивается узник, ожидающий в тюрьме смертного приговора, утверждая, что обладает сведениями государственной важности. Королю стало любопытно, и он его принял. Мужчина утверждал, что ранее был членом ордена тамплиеров и орден якобы отступил от веры Христовой. Рыцари предаются пьянству и разврату и на своих собраниях плюют на кресты и топчут их. Показания были записаны королевским секретарём.
Филипп выслушал приговорённого, передал в руки прокурора для подробного допроса, а затем помиловал, освободив из тюрьмы и наградив кошелем монет. Вероятнее всего, это был мошенник, оговоривший орден храмовников ради спасения жизни. Не исключено, что кто-то из вельмож почуял, откуда дует ветер, и подыграл.
Вскоре Филипп получил донос от двух бывших тамплиеров – Скина де Флориана и Ноффо Деи, в доносах говорилось о богохульстве храмовников, отрицании ими Христа, поклонении культу дьявола. Вероятно, и эти доносы были сфабрикованы придворными вельможами.
Король активизировал переговоры с папой Климентом, требуя роспуска ордена. Папа с трудом согласился лишь на расследование, да и то с большой годовой задержкой. Собранный 22 сентября 1307 года королевский совет принял решение об аресте всех тамплиеров на землях Франции. Три недели шли приготовления. Начальники военных отрядов, королевские чиновники, инквизиторы получили приказы от короля, запечатанные печатями в двойные конверты для соблюдения секретности.
Надпись на конверте гласила, что вскрыть их следовало в пятницу, 13 октября утром, а после действовать немедленно. Де Моле был арестован в этот же день в Тампле, резиденции ордена. Аресты начались по всей стране. Уцелели те, кто был в других странах в этот момент или не афишировал своё членство в ордене, как финансист Жан Рене из Авиньона.
Тюрьмы были забиты, инквизиция приступила к пыткам. Выдержать их могли немногие. Через неделю де Моле признал, что в ордене был обычай отрекаться от Христа и плевать на крест. Впрочем, вскоре он изменил показания.
Во времена короля Филиппа в Париже было несколько тюрем, главная из которых – Консьержери, как часть Дворца правосудия, расположенного на острове Сите, почти в центре столицы, на реке Сене. И самое страшное место в тюрьме – башня Бонбек, где содержались и подвергались пыткам государственные преступники. В дальнейшем в этой тюрьме побывал де Мариньи, сам отправлявший сюда людей и казнённый по приказу короля в 1314 году. Были и очень именитые узники – королева Мария-Антуанетта, учёный Антуан Лавуазье, Дантон, Робеспьер.