Угроза нашествия Тимура, ставшая реальной после первых его вторжений в 1394 и 1396 гг., вынудила малоазийских эмиров определить свою позицию к этому удачливому и жестокому завоевателю. В то время как Кади Бурханеддин выступил за совместные с Баязидом действия против Тимура, другие беи поспешили установить с ним дружественные связи. С его помощью они рассчитывали подорвать могущество как Баязида, так и Кади Бурханеддина и тем самым изменить соотношение сил в Анатолии в свою пользу. Такова была реакция Мутаххартена и спасшихся Караманидов. На приход Тимура надеялись и бывшие правители Эгейских эмиратов, тайком перебравшиеся в его ставку.
Гибель Кади Бурханеддина, внутренние неурядицы в Египте позволили Баязиду существенно расширить свои владения в Анатолии: он присоединил к ним земли Сивасского султаната, бейликов Джаник и Амасья, а также города Малатья, Эльбистан, Дивриги, ранее находившиеся под контролем мамлюков. Вместе с тем неизбежным оказалось и его столкновение с Тимуром. В решающем сражении в 1402 г. под Анкарой на сторону Тимура перешли войска, набранные в Кареси, Сарухане и Айдыне. Их примеру последовали отряды из Ментеше, Хамида и Гермияна. В результате Баязид потерпел сокрушительное поражение.
Чтобы не допустить возрождения османского могущества Тимур восстановил самостоятельность бейликов, но большинство из них, оказавшись в состоянии династийной и междоусобной борьбы, просуществовало лишь 15-20 лет. Все они были вновь поглощены Османским государством. К началу 20-х годов XV в. окончательно перестал {101} существовать бейлик Сарухан, спустя несколько лет — Ментеше, Айдын и Теке (часть Хамида, сохранившая свою самостоятельность после раздела княжества в конце XIV в.). В 1428 г. отказался от своих владельческих прав последний эмир Гермияна Якуб Челеби. Определенную самостоятельность сохранили до середины XV в. лишь несколько бейликов: в Западной Анатолии — Джандар (другое название Исфендиярогуллары), вобравший в себя соседние бейлики Синоп и Борлу, в Центральной Анатолии — Караман, заметно сократившийся со времен Тимура, в Юго-Восточной Анатолии — Зулькадирие и Рамазан, продолжавшие существовать благодаря покровительству мамлюкского Египта. Вне османских владений оставалась Восточная Анатолия, где шла упорная борьба между Каракоюнлу и Аккоюнлу.
В начале 60-х годов османский султан Мехмед II Фатих, осуществляя завоевание черноморского побережья Малой Азии, аннексировал владения Исфендиярогуллары. Затем в 1465 г. он направил свои войска против Карамана. Правители этого княжества пытались противостоять ему, вступив в союз с главой правящего клана Аккоюнлу Узун Хасаном и заручившись обещаниями о помощи со стороны Венеции, Венгрии и некоторых других европейских государств. Однако, как и прежде, попытки наладить совместные действия успеха не имели. В течение двух лет Мехмед Фатих сумел сломить сопротивление караманцев, но окончательно включить княжество в состав своего государства он смог лишь после победы в войне с Аккоюнлу. В сражении при Башкенте (1473) османская армия разгромила войско Узун Хасана и его союзника караманского бея. Благодаря этому успеху Фатиху удалось в основном завершить объединение Малой Азии под властью османской династии.