Вторая встреча в Санта-Фе состоялась 19 сентября 1945 г., когда Вторая мировая война была уже закончена. Германия и Япония капитулировали, Хиросима и Нагасаки лежали в руинах после взрывов ядерных зарядов. Учитывая сложную обстановку в небольшом городке Санта-Фе, где многие жители знали друг друга в лицо и где активно действовали службы контршпионажа, беседа Фукса и Голда проходила в автомашине ученого во время езды по известным ему окраинным дорогам и была непродолжительной.
Фукс рассказал, что 16 июня присутствовал при испытании первой атомной бомбы. После яркой ослепительной вспышки и взрыва, по его словам, небо над полигоном покрылось бело-багровым клубящимся пламенем.
От источника были получены письменное сообщение о дальнейших работах по совершенствованию производства плутониевой бомбы, а также данные о том, что США ежемесячно получают сто килограммов урана-235 и двадцать килограммов плутония. Цифры давали возможность советским ученым определить, сколько атомных бомб Соединенные Штаты могли производить в год. Однако на сей раз он не смог, как и прежде, ничего сообщить о технологии производства плутония.
В связи с тем, что вскоре ожидалось возвращение Фукса в Англию, ему передали условия явки с представителем советской разведки в Лондоне.
Это была последняя встреча с Фуксом в США.
Еще когда создание первой атомной бомбы не было завершено, некоторые ученые в Лос-Аламосе предлагали поделиться атомными секретами с Советским Союзом. В частности, с таким предложением к Рузвельту и Черчиллю письменно обратился лауреат Нобелевской премии Нильс Бор. Но его резко отчитали. Возможно, что такие настроения среди атомщиков еще больше побуждали мужественного Клауса Фукса тайно оказывать СССР как можно большую помощь.
Под давлением существовавшего среди ученых мнения об установлении международного контроля над атомным оружием в 1944 году американское правительство сочло необходимым подготовить и опубликовать отдельной книгой доклад о создании атомной бомбы в США. Часть этого доклада писали ученые Лос-Аламоса. Однако Пентагон подверг ее суровой редакции, и многое из написанного не увидело свет под предлогом секретности. В предисловии сообщалось: «В этом докладе не раскрываются военные секреты, касающиеся производства атомного оружия».
Доклад представили на одобрение Р. Оппенгеймеру, но он отказался поставить свою подпись под ним. По его мнению, документ носил «однобокий и вводящий в заблуждение» характер. Иными словами, в нем содержалась дезинформация, чтобы направить ученых других стран, и конечно в первую очередь СССР, при создании атомной бомбы по ложному пути.