Первоначально для наведения ракеты на цель предполагалось применить систему фотоэлектрического наведения Wassermaus. Рассматривалась также возможность применения системы инфракрасного наведения Paplitz. Но эти системы самонаведения ракеты не обеспечивали надёжного наведения, и началась разработка системы радиокомандного наведения по лучу радиолокатора. Первый вариант предусматривал использование одного наземного радиолокатора, который узким лучом подсвечивает цель, а бортовая система управления удерживает ракету в этом луче, но реализовать такую схему с достаточной надёжностью не удалось. Тогда было использованы два радиолокатора: первый - для сопровождения цели, второй - для сопровождения ракеты. Оператор наблюдал на экране отметки цели и ракеты, и должен был их совместить вручную рукоятками управления. Сигналы с рукояток управления поступали на счётно-решающее устройство, преобразовывались в команды управления и по радиоканалу передавались на борт ракеты, где бортовое оборудование их дешифровало в сигналы для рулей управления. В июне 1944 года было проведено испытание радиокомандной системы наведения, которая была установлена на ракете А-4 ("Фау-2"). Испытания проводились на полигоне Пенемюнде. Система давала возможность оператору наземной станции стабилизировать ракету в полете по тангажу и крену с помощью самолетных ручек управления. Эта задача была возложена на одного инженера, который до этого имел дело с системой дистанционного управления только на испытаниях моделирующих устройств. Когда ракета достигла высоты 1800 м, он потерял ее из виду, потому что линию визирования закрыли кучевые облака. Чтобы не допустить падения ракеты на побережье к югу от стартовой позиции, инженер-оператор умышленно раздернул ракету в северном направлении, и она ушла в сторону Швеции. Нейтральные шведы выразили немцам протест. Узнав об этом, англичане попросили, чтобы шведы передали им этот "образчик", и шведы выполнили просьбу. [5]
Послевоенные сообщения о том, что ракета "Вассерфаль" применялась в боевой обстановке, были ошибочными. Найденные протоколы 40 экспериментальных пусков говорят о том, что лишь в 14 случаях пуски ракет были "вполне успешными". [5]
В своих мемуарах, опубликованных в 1969 году, рейхсминистр вооружений и военной промышленности фашистской Германии Альберт Шпеер пишет:
"Можно сказать, что мы прямо-таки испытывали трудности от обилия проектов и разработок. Концентрация на нескольких немногих типах вооружения позволила бы, конечно, многое довести до конца намного раньше. Недаром на одном из совещаний ответственной инстанции было решено не столько увлекаться впредь новыми идеями, а отобрать из наших уже реальных проектных заделов разумное и соответствующее нашим производственным возможностям количество типов и решительно продвигать их.