Если раньше не представляли, что делать с каторжниками, то теперь их катастрофически не хватало. На Лубянку летели просьбы прислать новые партии заключенных. Вот теперь наступила очередь разобраться с теми, кто мешал работать ему, Френкелю.
Первым стал высокопоставленный московский чиновник Коган, посмевший спорить с Френкелем по поводу воспитательно-трудовых лагерей. Чуть позже, но тоже достаточно быстро исчез где-то в недрах ГУЛАГа старый знакомый Френкеля Терентий Дерибас. С другими врагами Нафталия Ароновича разобрались бывшие его покровители. И его славная карьера стремительно пошла в гору.
В 1930 году Френкель руководил строительством ИТЛ в республике Коми. В 1931-м он был главным прорабом Беломорстроя. Чуть позже стал заместителем начальника Белбалтлага. Его бросали на «самые сложные участки социалистического строительства» — то бишь на открытие новых лагерей в непростых природных условиях, совершенно не подходящих для человеческого существования. И он никогда не подводил. За заслуги перед Родиной в августе 1933 года Нафталий Аронович Френкель был награжден орденом Ленина.
Семнадцатого августа 1933 года орденоносца Френкеля назначили начальником управления БАМа; он получил от правительства невероятные по тем временам суммы. Отточенное годами чутье коммерсанта и преступника позволило ему быстро оборачивать часть средств. Нажитые деньги он пустил на подкуп и взятки. Действовал он открыто и нагло. Ему почти ничто не угрожало. Вся экономика БАМа находилась в его руках. И тут произошла осечка — наступил 1937 год.
Ему были предъявлены настолько весомые обвинения, что приговор мог быть только один — расстрел. Недруги Френкеля уже вздохнули с облегчением. Но надо было знать Нафталия Ароновича и помнить о его дьявольским везении. В 1940 году его освободили по личному распоряжению Берии. И не просто освободили — он получил звание коринженера и второй орден Ленина. Двадцать девятого октября 1943 года ему присвоили звание генерал-лейтенанта инженерно-технической службы и вручили третий орден Ленина.
И вдруг Френкель решил одним махом прекратить все свои операции. Выработанная с годами интуиция, судя по всему, подсказала ему, что на избранном им поприще социалистического строительства идеальной системы рабства, которой уже стал ГУЛАГ, большего достичь не удастся. Тем более что он владел информацией о происходящем в министерстве внутренних дел и госбезопасности. Френкель понял, что грядут чудовищные чистки, и, естественно, пытался избежать страшной участи. Ведь в третий раз ему могло и не повезти. Чтобы уволиться, требовался серьезный повод. Френкель, как обычно, дал взятку и 28 апреля 1947 года подал в отставку по причине серьезной болезни. Его проводили с почестями и очередной правительственной наградой.