Вследствии распутицы военные действия прекратились и начались только в мае м-це. Пугачев в это время находился на Белорецком заводе. 5 мая Михельсон разбил башкир у Симского завода и двинулся против Пугачева. Пугачев бросился к крепости Магнитной и овладел ею; затем он направился к крепости Кизильской, но услышав, что из крепости Верхне-Яицкой против него двигаются сибирские войска под начальством Декалонга, свернул в горы и, обойдя Верхне-Яицкую крепость, вышел на линию у крепости Карагайской. Двигаясь по Верхне-Уйской линии, Пугачев сжег по ней все крепости и 20 мая овладел крепостью Троицкой.
Вслед за ним шел отряд Декалонга, который 21 мая настиг Пугачева под крепостью Троицкой Здесь произошло большое сражение. На стороне Пугачева сражалось 11 тыс. войск, но они были разбиты.
После поражения под Троицкой, Пугачев пошел на Челябинск. Под крепостью Варламовой его встретил полковник Михельсон и нанес ему новое поражение. Пугачев повернул в Уральские горы, где набрал себе новые ополчения.
20 июня он взял крепость Осу, а 25-го переправился через реку Каму. Двигаясь по дороге на Казань, он овладел Ижевским и Боткинским заводами и, наконец, 11-го июля атаковал г. Казань.
Войска казанского гарнизона, дворянство и духовенство заперлись в крепость. Город оказался в руках Пугачева.
На другой день после занятия города подошел полковник Михельсон со своим отрядом. В сражениях, длившихся с 13 по 15-го июля, Пугачев был снова разбит; при этом он потерял до 2000 убитыми, 5000 пленными и 9 орудий.
После поражения под Казанью Пугачев переправился на правый берег Волги. В своих манифестах он объявил крестьянам вольность, освобождение от податей и повинностей и бесплатную раздачу соли, призывая их на борьбу с дворянством.
При приближении Пугачева крестьянство восставало против своих бар и встречало его, как своего избавителя. Это был момент колоссального роста его сил, самый опасный для правительства. Движение Пугачева на Москву могло бы превратиться в триумфальное шествие. Крестьянство Центральной России, рабочие Тульских заводов и Москвы могли к нему присоединиться. Но Пугачев вместо того, чтобы идти на Москву, взял направление на юг России. По дороге он занял гор. Курмыш, Саранск и Пензу. Повсюду жители городов выходили к нему на встречу с хлебом и солью. Он нигде не встречал сопротивления; 6-го августа Пугачев занял г. Саратов, где выпустил из тюрьмы всех колодников, отворил хлебные и соляные амбары для общего пользования народа и повесил всех дворян, запрещая хоронить их тела. Комендантом города был назначен казацкий пятидесятник Уфимцев.