В начале 1796 года Блай становится командиром Его Величества Судна «Директор», 64-пушечного военного корабля. 19 мая 1797 года команда «Директора» присоединяется к самой массовой забастовке в истории флота — так называемому «Великому Мятежу в Норе» — и отправляет капитана Блая на берег.
После подавления мятежа Блай вновь возглавил «Директор», с которым в октябре того же 1797 года участвовал в битве с голландцами у Кампердауна. В сентябре 1800 года Блай приглашен в Дублин, где в течение трех месяцев он проводит исследование дна и обмеры глубин Дублинского залива. В 1801 году — битва с датчанами у Копенгагена (54-пушечный корабль «Глаттон»), после которой Блай заслужил похвалу самого адмирала Нельсона. 1804 год отмечен тем, что Блай в качестве командира военного судна «Уорриор» предстал перед трибуналом «за тираническое и репрессивное поведение» и «оскорбительную речь» и получил выговор.
На следующий год Блай в 51-летнем возрасте был назначен губернатором провинции Новый Южный Уэльс (Австралия). 26 января 1808 года против Блая вспыхнул очередной мятеж, вошедший в историю как «ромовый бунт»: восставшие офицеры сместили Блая и заключили его под домашний арест.
Спустя два года, в 1810 году, после прибытия нового губернатора, Блай вернулся в Англию. В результате судебного разбирательства он был реабилитирован, но его активная карьера на этом завершилась. Он поселился с семьей в Лондоне.
Дважды его повышали в звании «за выслугу лет»: в 1812 году он стал контр-адмиралом, в 1814 — вице-адмиралом флота. 15 апреля 1812 года в возрасте 59 лет умирает его верная жена Элизабет. Блай пережил ее на пять с половиной лет и умер от рака 7 декабря 1817 года, в 63-летнем возрасте. Похоронен рядом с супругой на кладбище церкви Сэйнт Мэри в Ламбете, Лондон (сегодня — Музей Истории Садоводства).
Уильям Блай оставил после себя шестерых дочерей: Хэрриет, Мэри, Элизабет, Фрэнсис, Джейн и Энн. Именем Блая на морских картах назван один из проходов в Большом Барьерном Рифе (Австралия) и пролив к северу от о. Вити Леву в архипелаге Фиджи.
Роль Блая в кино исполняли такие артисты, как Джордж Кросс («Мятеж на „Баунти“», 1916), Мэйн Линтон («По следам „Баунти“», 1933), Чарльз Лаутон («Мятеж на „Баунти“», 1935), Тревор Хауард («Мятеж на „Баунти“», 1962) и, наконец, Энтони Хопкинс («Баунти», 1984).
В настоящее время потомки Блая живут в Австралии, Новой Зеландии, Соединенном Королевстве и США.
Уильям Браун, садовник
Родился в Лейстере (Англия) приблизительно в 1762 году. По некоторым данным служил в Королевских Кью Гарденз садоводом. Браун и ботаник Нельсон стали первыми, кого 5 мая 1787 года, еще до того, как выбрали судно, по ходатайству сэра Дж. Бэнкса назначили в экспедицию за хлебным деревом.