Борис Березовский попытался вернуться на политическую сцену России, после того как после завершения президентства Дмитрия Медведева Владимир Путин решил вновь баллотироваться в президенты России. В Москве и других российских городах в конце 2011 года впервые за много лет прошли массовые демонстрации протеста против фальсификаций на думских выборах в пользу правящей «Единой России» и против намерения Путина в третий раз стать президентом, что, по мнению внесистемной оппозиции, противоречило российской Конституции.
29 мая 2012 года Следственный комитет России (СКР) сообщил о возбуждении против Бориса Березовского двух уголовных дел по признакам состава преступления, предусмотренного пунктом 3 статьи 212 УК РФ (призывы к активному неподчинению законным требованиям представителей власти и к массовым беспорядкам). Первое уголовное дело было возбуждено по факту размещения Березовским в апреле 2012 года в сети интернет обращения, в котором следователи СКР увидели призывы к массовым беспорядкам, сопровождающимся насилием, адресованные гражданам России: «К совершению в общественных местах в городе Москве массовых активных противоправных действий в целях насильственного воспрепятствования инаугурации законно избранного президента РФ и его допуску в Кремль 7 мая, обещая денежное вознаграждение за его задержание и ограничение свободы передвижения». Второе уголовное дело было возбуждено по факту публикации 1 февраля 2012 на сайте радиостанции «Эхо Москвы» «Открытого письма рожденным не в СССР». В нем усмотрели призывы к массовым беспорядкам, а именно к совершению активных противоправных действий по силовому противостоянию представителям власти в целях насильственного воспрепятствования проведению президентских выборов. Оба дела, объединенных в одно, были закрыты после смерти Березовского.
Поводом к возбуждению данных уголовных дел послужил ряд обращений Березовского с призывами к уходу Путина от власти. 15 января 2012 года Березовский писал патриарху Кириллу:
«Ваше Святейшество!
Не надежда, а Вера умирает последней. Можно сколько угодно говорить о воскрешении Веры, о возрождении православия, реставрировать старые и строить тысячи новых храмов, но никакой ритуал не подменит Веры. Именно дефицит Веры есть главная беда России.
Россия теряет веру в правду, веру в справедливость, веру в себя. Народ утратил веру во власть и может потерять веру в церковь. Власть не доверяет собственным гражданам. Неужели и церковь способна утратить веру в своих прихожан?
Ваше Святейшество!
За Вами тысяча лет православия, а впереди тяжелейшие испытания. В этом году Вам придется войти в историю.